公司请假扣工资是否合法，需根据请假类型、公司规章制度、法律法规及劳动合同或集体合同的约定来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法情况
事假扣工资：
- 法律依据：根据劳动法相关规定，职工因个人原因请事假，企业有权不支付其事假期间的工资。这是因为事假属于员工个人原因导致的非正常出勤，企业无需承担该时段的薪酬支付义务。
- 扣款计算：事假扣款通常按照“月工资÷21.75×请假天数”来计算，其中21.75为劳动法规定的月计薪天数。这一计算方式确保了扣款的合理性及透明度。
- 合同与制度：企业在执行事假扣薪时，应确保扣款行为符合劳动合同的约定及企业内部规章制度的规定，不得无故或过度扣除员工工资。
病假扣工资（在合法范围内）：
- 法定标准：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，且不得低于当地最低工资标准的80%。
- 合同与制度：若劳动合同或集体合同中有关于病假工资的明确约定，且约定标准高于法定标准或企业内部规章制度标准，企业应当按照约定执行。
请假影响工作绩效时的绩效工资扣减：
- 当员工请假导致其无法完成既定的工作任务或目标，进而对整体绩效产生实质性影响时，单位可以依据绩效评估体系扣减绩效工资。但这种扣减必须是基于客观、公正的绩效评估结果，并且扣除的金额和方式应合理。
不合法情况
低于法定标准扣病假工资：
- 如果企业扣减病假职工的工资低于当地最低工资标准的80%，则这种行为是不合法的。
无规章制度或未公示扣工资：
- 如果单位没有相关规章制度，或者规章制度的制定未经过民主程序且未向劳动者公示，就随意扣发工资，这也是违法的。
违反劳动合同或集体合同扣工资：
- 如果企业违反劳动合同或集体合同中关于工资的明确约定，扣减工资，则同样是不合法的。
特定假期扣工资：
- 员工在享受带薪年休假、婚假、产假、陪产假、丧假等法定假期时，单位不得随意以请假为由扣工资。这些假期是法律赋予劳动者的基本权益，单位应保障员工在这些假期期间的工资待遇。
特殊情况与建议
- 劳动合同或集体合同约定：如果劳动合同或集体合同中对请假扣工资有明确的约定，并且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照合同的约定来执行。
- 员工维权：若认为公司扣工资行为不合理或违法，员工首先应与公司进行沟通协商，尝试解决问题。协商不成时，员工可向当地劳动管理部门进行投诉或举报，寻求官方介入处理。必要时，员工可依法向当地人民法院申请支付令或提起诉讼，以维护自身合法权益。
总结来说，公司请假扣工资是否合法，需根据具体情况综合判断。在处理此类问题时，公司应确保规章制度的合法性及合理性，遵守相关法律法规和劳动合同的约定，并保障员工的合法权益。同时，员工也应了解自己的权利和义务，在必要时寻求法律援助以维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。