植种公司让农民用化肥是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
如果植种公司与农民之间存在合法有效的合同关系，且合同中明确约定了农民需要使用植种公司提供的化肥：
- 在这种情况下，农民按照合同约定使用化肥是合法的。因为合同是双方自愿达成的协议，具有法律约束力，双方都应当履行合同约定的义务。
- 但需要注意的是，合同中的条款必须合法合规，不能违反法律法规的强制性规定。例如，合同中不能约定农民必须使用过量或者有害的化肥，否则这样的条款是无效的。
如果植种公司没有与农民签订合同，或者合同中没有明确约定农民需要使用植种公司提供的化肥，而是植种公司单方面要求农民使用：
- 在这种情况下，农民是否有义务使用化肥就取决于具体的法律法规和实际情况了。
- 如果植种公司的要求违反了法律法规的强制性规定，比如要求农民使用禁用或者限用的化肥，那么农民有权拒绝使用，并且可以向相关部门举报植种公司的违法行为。
- 如果植种公司的要求没有违反法律法规，但是农民认为使用化肥不符合自己的种植习惯或者经济利益，那么农民也可以拒绝使用。不过，这种情况下农民可能需要承担一定的后果，比如植种公司可能会因此减少与农民的合作或者采取其他措施。
法律建议：
- 对于农民来说，在签订与植种公司的合同时，一定要仔细阅读合同条款，特别是关于化肥使用的部分，确保自己的权益不受侵害。
- 如果植种公司提出使用化肥的要求，农民有权要求植种公司提供化肥的相关信息，比如化肥的成分、使用方法、可能产生的后果等，以便农民做出明智的决策。
- 如果农民认为植种公司的要求不合理或者违法，可以向当地的农业部门、市场监管部门或者法律援助机构寻求帮助。
可能产生的法律后果：
- 如果农民按照合同约定或者法律法规的规定使用化肥，那么一般不会产生法律后果。
- 如果农民拒绝使用化肥而植种公司因此采取不当措施（比如扣减农民的收益、解除合同等），农民可以通过法律途径维护自己的权益。
- 如果植种公司要求农民使用违法或者有害的化肥，那么植种公司可能会面临行政处罚或者民事赔偿等法律后果。
总之，植种公司让农民用化肥是否合法，取决于合同约定和法律法规的规定。农民在面对这种情况时，应当保持警惕，仔细阅读合同条款，了解相关法律法规，必要时寻求法律帮助。如果你有具体的法律问题或者需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。