在原配起诉小三返还夫妻共同财产一案中，小三转给原告丈夫的款项是否需要扣除，这主要取决于该款项的性质以及是否构成对夫妻共同财产的返还义务。以下从几个关键角度进行分析：
款项性质与返还义务：
- 如果小三转给原告丈夫的款项，是原告丈夫之前擅自赠与给小三的夫妻共同财产的一部分，那么这部分款项在法律上可能被视为对之前不当得利的返还。在这种情况下，小三有义务返还这部分财产，因为它原本就属于夫妻共同财产，且小三取得该财产并无法律依据。
- 然而，如果小三转给原告丈夫的款项是出于其他原因，如借款、投资回报或双方之间的其他合法交易，那么这部分款项可能不构成对夫妻共同财产的返还义务，因此在计算应返还的财产时可能不需要扣除。
法律原则与裁判规则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定（注意，此处已引用最新法律，原《民法总则》、《婚姻法》等已废止），因他人没有法律根据，取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。在夫妻共同财产被擅自赠与给小三的情况下，夫妻另一方有权要求返还该财产。
- 裁判实践中，法院通常会认定夫妻一方擅自将共同财产赠与婚外第三者的行为无效，并判决第三者返还全部或部分财产。这取决于具体案情，如赠与财产的数额、小三是否知情、是否构成善意取得等因素。
实际操作与证据收集：
- 在实际操作中，要确定小三转给原告丈夫的款项是否需要扣除，需要收集相关证据来证明款项的性质和来源。这可能包括银行转账记录、聊天记录、证人证言等。
- 如果能够证明该款项是之前赠与财产的返还，那么在计算应返还的财产时应当予以扣除。反之，如果无法证明或证据不足，则可能无法扣除。
建议：
- 在处理此类案件时，建议尽快收集相关证据，以证明款项的性质和来源。
- 咨询专业律师（即我本人，胡森轩律师，专注于婚姻家庭领域），以便更准确地评估案情和制定诉讼策略。
- 根据律师的建议和案情的具体情况，决定是否需要扣除小三转给原告丈夫的款项。
总结：小三转给原告丈夫的款项是否需要扣除，取决于该款项的性质以及是否构成对夫妻共同财产的返还义务。在处理此类案件时，应收集相关证据并咨询专业律师以制定合适的诉讼策略。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。