实习生周六周日加班工资的计算需分情况讨论，主要取决于实习生与用人单位之间的法律关系性质及具体约定，具体分析如下：

1. 若实习生与用人单位构成劳动关系
   根据《劳动法》第四十四条及《工资支付暂行规定》第十三条，周六周日属于休息日，若用人单位安排加班且无法安排补休的，应支付不低于工资200%的加班工资。

   • 计算基数：以实习生劳动合同约定的正常工作时间工资为基准（不得低于当地最低工资标准）。
     
   • 计算公式：日加班工资 = 月工资÷21.75天（月计薪天数）×200%；小时加班工资 = 日工资÷8小时×200%。
     
   • 例外情形：若用人单位已安排补休（如调休至工作日），则无需支付加班工资。

2. 若实习生与用人单位构成劳务关系（如在校学生实习）
   根据《民法典》合同编相关规定，双方权利义务以书面协议约定为准。若协议未明确约定加班工资，则实习生无权主张法定加班费，但可依据以下途径维权：

   • 协商补休：与用人单位协商安排调休或补偿休息时间。
     
   • 协议追索：若协议中约定了加班补偿标准（如按小时支付额外报酬），可按约定主张。
     
   • 特殊保护：部分地区（如上海）规定，非全日制在校学生实习期间，用人单位应参照同岗位工资标准支付劳动报酬，但未明确加班工资规则，需结合地方性法规进一步判断。

实务建议：

• 劳动关系实习生：务必保留考勤记录、加班通知等证据，若用人单位拒付加班费，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  
• 劳务关系实习生：签订实习协议时，建议明确约定加班补偿条款（如“周末加班按日工资150%支付”），避免口头约定。
  
• 风险提示：若用人单位以“实习”名义规避劳动关系，但实际管理符合劳动关系特征（如强制考勤、纳入绩效考核），可能被认定为事实劳动关系，此时应按劳动关系主张权益。

如有进一步疑问（如协议条款审查、证据固定等），可直接向我咨询。