若再审诉讼时效已经超期，但法院仍违法开庭，可采取以下措施维护合法权益：

1. 及时提出异议
   在庭审过程中，应立即向法庭提出诉讼时效抗辩，明确指出再审申请已超过法定时效期间，要求法院依法驳回再审申请或终止审理。根据《民事诉讼法》及相关司法解释，再审申请应在判决、裁定生效后六个月内提出（特定情形可延长），超期后法院原则上不应受理或继续审理。

2. 申请法院自行纠正
   若法院未主动审查时效问题，可在庭审后向法院提交书面异议，引用《民事诉讼法》第207条（再审事由）及第212条（审查期限），要求法院依职权审查再审申请是否符合时效规定。若法院仍不纠正，可进一步通过上级法院监督程序维权。

3. 向上级法院申诉或申请检察监督

   • 申诉途径：向上一级法院提交《申诉书》，说明再审申请超期且法院违法审理的事实，请求上级法院指令下级法院撤销案件或直接提审。
     
   • 检察监督途径：向同级或上级检察院申请检察建议或抗诉，依据《人民检察院民事诉讼监督规则》第21条，检察院可对法院违法审理行为提出纠正意见。

4. 保留证据并主张程序违法
   若法院最终作出再审判决，可在后续救济程序中（如另案诉讼或执行异议）主张原再审程序违法，要求撤销相关判决或裁定。需重点保留以下证据：

   • 再审申请书及送达回证（证明申请时间）；
     
   • 法院受理通知书及开庭传票（证明法院违法审理）；
     
   • 庭审笔录（记录时效抗辩提出情况）。

风险提示：

• 再审时效为不变期间，不适用中止、中断规定，超期后法院原则上不得启动再审程序。
  
• 若法院已违法开庭，需在判决作出前尽快采取上述措施，避免因未及时抗辩导致权利丧失。
  
• 程序违法不必然导致实体判决无效，需结合具体案情判断是否构成再审事由。

建议行动步骤：

1. 立即整理再审申请材料及法院受理文件，计算时效期间；
   
2. 撰写书面《时效抗辩意见书》并提交法庭；
   
3. 同时向上级法院和检察院提交监督申请，形成双重救济压力；
   
4. 密切关注案件进展，及时应对法院可能的程序操作。
   

如有进一步证据或案情细节需要分析，可直接向我提供具体材料，我将结合《民事诉讼法》及相关司法解释为你制定更精准的维权方案。