员工旷工自离不结算工资是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律条款依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论劳动者是否旷工或自动离职，用人单位都无权单方面决定不支付其应得的工资。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，与旷工行为是两个独立的法律问题。
2. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条第一款：进一步强调用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这一条款为劳动者维护自身权益提供了明确的法律支持。
3. 《工资支付暂行规定》第十六条：指出因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但经济损失的赔偿可以从劳动者本人的工资中扣除，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这一规定限制了用人单位在扣除工资时的权限，保护了劳动者的基本生活需求。

实际情况分析

1. 旷工与工资支付的关系：旷工是违反公司规章制度的行为，但并不意味着用人单位可以因此不支付工资。用人单位应当通过合法途径处理旷工问题，如依据公司规章制度进行处罚（如警告、罚款等）或解除劳动合同，但不能以旷工为由拒绝支付工资。例如，小李在某公司工作，某月旷工了3天，但其余时间正常出勤，公司不能因为这3天的旷工就拒绝支付小李整个月的工资，而应扣除旷工3天对应的工资后，支付剩余应得工资。
2. 自动离职的工资支付：即使劳动者选择自动离职，用人单位也应当支付其已提供劳动部分的工资。自动离职并不等同于放弃工资权益，劳动者仍有权要求用人单位支付其应得的工资。比如，小张在未办理离职手续的情况下离开了公司，但他在离职前已经为公司工作了一段时间，公司不能以此为由拒绝支付小张工作期间的工资。

用人单位的合法操作建议

1. 完善规章制度：用人单位应制定完善的规章制度，明确旷工的定义、处理方式以及工资支付的相关规定。确保规章制度的内容合法、合理，并经过民主程序制定和公示。例如，公司可以在规章制度中规定，旷工一天扣除当天工资的200%（但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准），同时对于连续旷工达到一定天数的，公司有权解除劳动合同。
2. 依法处理旷工行为：对于旷工行为，用人单位应按照规章制度进行处理，如警告、罚款、解除劳动合同等。在处理过程中，应确保程序合法、证据充分，避免侵犯劳动者的合法权益。比如，公司在发现员工旷工后，应及时与员工沟通，了解旷工原因，并按照规章制度进行处理，同时保留好相关的证据，如考勤记录、沟通记录等。
3. 及时支付工资：无论劳动者是否存在旷工或自动离职的情况，用人单位都应及时支付其应得的工资。如遇特殊情况需要延迟支付，应与劳动者进行沟通并说明原因。

劳动者的维权途径

如果用人单位以旷工自离为由拒发工资，劳动者有多种途径可以维护自身权益：

1. 协商解决：劳动者首先可以尝试与用人单位进行协商沟通，说明工资支付的法律规定，要求单位支付应得工资。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期支付工资。
3. 申请劳动仲裁：劳动者还可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，劳动者需要提供相关证据材料来证明自己的权益受到侵害，如工作记录、工资条、劳动合同等。
4. 提起诉讼：对于仲裁结果不满意的一方，还可以向人民法院提起诉讼来维护自己的合法权益。

总之，员工旷工自离不结算工资是违法的行为，用人单位应依法支付劳动者正常出勤期间的工资。如果你遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律帮助。