结论：在合伙协议约定退股放弃股权，但后来又通过微信聊天达成“慢慢回本，亏多少补多少”的约定时，应以哪份约定为准，这主要取决于新约定的性质、双方的真实意思表示以及相关证据的充分性。一般来说，如果微信聊天中的约定构成了对原合伙协议的变更或补充，且双方均认可该约定，那么该新约定可能具有更高的法律效力。

分析角度一：合同变更的法律原则

1. 合同变更的合法性：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。这意味着，如果双方通过微信聊天达成了新的约定，并且这一约定是双方真实意思的表示，没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么这一新约定是合法的，对双方具有约束力。

2. 新约定的优先级：在合同变更的情况下，新约定的内容通常会取代或补充原合同中的相应内容。因此，如果微信聊天中的约定明确了对退股和股权处理的新方式，且这一方式与原合伙协议中的约定不同，那么新约定在双方之间应具有更高的法律效力。

分析角度二：证据的充分性与证明力

1. 微信聊天的证据效力：微信聊天作为电子数据，其证据效力在司法实践中已得到广泛认可。然而，要证明微信聊天中的约定是双方的真实意思表示，且构成了对原合伙协议的变更或补充，需要提供充分的证据。这包括但不限于微信聊天的完整记录、双方的身份确认、聊天内容的明确性等。

2. 证据的对比与权衡：在存在多份约定的情况下，法院或仲裁机构在裁决时通常会考虑各份证据的充分性、证明力以及它们之间的逻辑关系。如果微信聊天中的约定在证据上更为充分、明确，且能够合理解释原合伙协议中的相关条款，那么这一新约定更有可能被采纳。

分析角度三：实际履行情况与交易习惯

1. 实际履行情况：如果双方在微信聊天达成新约定后，已经按照新约定进行了实际履行（如一方已经按照“亏多少补多少”的原则进行了补偿），那么这一实际履行情况可以作为支持新约定效力的有力证据。

2. 交易习惯：在商业实践中，交易习惯也是判断合同内容的重要依据。如果双方在长期的合作过程中形成了特定的交易习惯，且这一习惯与微信聊天中的新约定相符，那么这一习惯也可以作为支持新约定效力的参考。

建议与风险提示：

• 明确约定：为了避免类似的纠纷，建议双方在达成任何新的约定时，都尽量采用书面形式，并明确约定变更或补充的内容、生效条件等。
• 保留证据：无论是原合伙协议还是微信聊天中的新约定，都应妥善保留相关证据，以备不时之需。
• 咨询专业意见：在涉及复杂的法律问题时，建议及时咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保障。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。