迟到早退扣工资是否违法，关键在于用人单位的规章制度是否合法、合规且合理。以下从多个角度为你详细分析：
一、合法情形
规章制度明确且合理
- 用人单位应依法制定内部规章制度，明确规定迟到早退的扣薪标准。这一标准需经过民主程序制定，如职工代表大会或全体员工讨论通过，并已向员工公示告知。例如，规章制度中可以规定“迟到一次扣除当日工资的10%，但每月累计扣除不超过当月工资的20%”，这样的规定既明确又合理。
- 扣薪标准应公平合理，不能明显侵害劳动者权益。它通常应考虑企业实际情况、行业惯例及迟到早退对工作的影响程度。如果扣薪标准过高，导致员工工资大幅减少，甚至影响其基本生活，那么这种扣工资行为可能被认定为不合法。
劳动合同有约定
- 若劳动合同中明确约定了迟到早退属于违反合同约定的行为，并规定了相应的扣薪条款，该条款也需公平合理。例如，劳动合同中可以约定“员工迟到早退，每次扣除当日工资的5%，但每月累计扣除不超过当月工资的15%”。
- 劳动合同中的扣薪约定应与规章制度相一致，且不能违反法律法规的强制性规定。如果劳动合同中的扣薪条款与规章制度相冲突，或者违反了法律法规的强制性规定，那么该条款可能无效。
扣罚合理
- 扣工资的额度应当合理，确保扣罚金额与员工的过错相适应。根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 对于仅仅是迟到早退而未给单位造成实际经济损失的情况，如果扣除了较大比例的工资（如当天甚至几天的工资），这显然是不合理的，也属于违法行为。
二、不合法情形
无规章制度或程序不合法
- 用人单位没有相关规章制度，或规章制度的制定程序不合法（如未经过民主程序、未公示告知），则直接扣工资的行为不合法。例如，如果用人单位没有制定任何关于迟到早退扣工资的规章制度，或者规章制度只是由个别领导决定，没有经过职工代表大会或全体员工讨论通过，也没有向员工公示告知，那么这种扣工资行为就是违法的。
扣罚标准过高或不合理
- 如果扣罚标准过高，导致员工工资大幅减少，甚至影响其基本生活，这种扣工资行为也可能被认定为不合法。例如，如果规章制度中规定“迟到一次扣除当日全部工资”，这样的规定显然过高，不合理，也是违法的。
- 扣罚标准应与实际情况相符，不能明显偏高或偏低。如果扣罚标准过低，无法起到约束员工的作用，那么这种规章制度也可能被视为不合理。
三、员工权益保护
面对不合法的扣工资行为，员工可以采取以下措施维护自己的合法权益：
与用人单位协商解决：首先尝试与用人单位沟通，表达异议和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。例如，员工可以向用人单位提出规章制度不合理或扣罚标准过高的意见，要求用人单位进行修改或调整。
向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，并要求用人单位改正。
申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，员工可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。劳动仲裁机构或法院将根据相关法律法规和规章制度，对扣工资行为进行合法性审查，并作出公正裁决。
总结来说，迟到早退扣工资是否违法，取决于用人单位的规章制度是否合法、合规且合理。如果用人单位的规章制度符合上述条件，且扣工资行为在合理范围内进行，那么这种行为就是合法的；反之，则是违法的。作为员工，应了解自己的权益和维权途径，并在必要时依法维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。