核心结论：集体荒山被个人侵占，集体组织或相关权利人可通过协商、行政投诉、民事诉讼等途径要求侵占人停止侵害、返还荒山并赔偿损失。具体如下：

1. 协商解决
   首先可尝试与侵占人直接沟通，明确要求其停止侵占行为、返还荒山并赔偿损失。协商时需注意保留证据（如沟通记录、现场照片等），若侵占人承认侵占事实并同意赔偿，可签订书面协议明确赔偿金额、方式及期限，避免后续纠纷。

2. 行政投诉
   若协商无果，可向当地自然资源部门（原国土资源部门）或农业农村部门投诉。根据《土地管理法》第七十七条，未经批准非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地；对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。行政机关介入后，可要求侵占人返还荒山，并对其违法行为进行处罚（如罚款），但行政程序一般不直接解决赔偿问题，需另行主张。

3. 民事诉讼
   若需主张赔偿，可直接向法院提起民事诉讼，要求侵占人承担侵权责任。诉讼要点如下：

   • 原告主体资格：需证明对荒山享有合法权利（如集体土地所有权证、承包经营权证等）。若荒山属集体所有，应以集体经济组织或村民委员会名义起诉；若属国家所有但由集体使用，需提供相关管理文件。
     
   • 侵权事实证据：包括荒山权属证明、侵占行为证据（如现场照片、视频、证人证言等）、损失计算依据（如荒山被占用期间的收益损失、恢复原状费用等）。
     
   • 诉讼请求：可要求侵占人停止侵害、返还荒山、赔偿损失（包括直接损失和间接损失）。若荒山被破坏，还可主张生态修复费用。
     
   • 诉讼时效：根据《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算。

4. 刑事报案（若构成犯罪）
   若侵占行为涉嫌犯罪（如非法占用农用地罪），可向公安机关报案。根据《刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。刑事程序启动后，侵占人可能面临刑事处罚，同时集体组织仍可通过民事诉讼主张赔偿。

建议：处理此类纠纷时，建议优先通过协商或行政投诉解决，效率较高；若涉及复杂法律问题或赔偿金额较大，可委托律师协助调查取证、起草法律文书并参与诉讼，以最大限度维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。