将果树种在公共水沟里，这一行为是否违法，需结合具体情况来判断，但通常情况下，这种行为可能涉及违法或侵权问题。以下从不同角度为你详细分析：

一、从土地使用权和规划角度

公共水沟通常属于公共设施用地，其使用权和管理权归相关部门或集体所有，个人无权擅自占用或改变其用途。如果果树种植行为未经相关部门或集体同意，擅自占用了公共水沟，那么这一行为很可能违反了土地管理法和城乡规划法的相关规定，属于违法行为。

二、从相邻关系角度

即使果树种植行为未直接违反土地管理法和城乡规划法，但如果该行为对公共水沟的正常使用造成了影响，比如阻碍了水流、影响了排水功能等，那么这一行为也可能构成对相邻关系的侵害。根据民法典中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。因此，如果果树种植行为对公共水沟的正常使用造成了妨碍，相邻权利人有权要求停止侵害、排除妨碍。

三、从侵权责任角度

如果果树种植行为不仅影响了公共水沟的正常使用，还导致了其他损害后果，比如因水流不畅导致周边土地被淹、房屋受损等，那么这一行为还可能构成侵权行为。根据民法典中关于侵权责任的规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。因此，在这种情况下，受害者有权要求果树种植者承担相应的赔偿责任。

建议与措施

1. 立即停止侵害行为：如果果树已经种植在公共水沟里，且该行为确实对公共水沟的正常使用造成了影响或可能构成违法行为，那么建议立即停止侵害行为，并尽快将果树移走或采取其他补救措施。

2. 与相关部门或集体协商：在停止侵害行为的同时，建议与相关部门或集体进行协商，了解具体的土地使用规定和规划要求，以便更好地处理后续事宜。

3. 承担相应责任：如果果树种植行为已经导致了损害后果，那么建议积极承担相应的赔偿责任，以避免进一步的法律纠纷。

如果你在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。