子公司签署合同后，在符合一定条件下可以付款给母公司。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、合同相对性原则与付款主体
在合同法中，合同相对性原则是一个基本原则，即合同主要约束合同双方当事人，合同的权利和义务也主要在合同双方之间产生。子公司作为独立的法人实体，其签署的合同原则上应由子公司自身履行付款义务。然而，这并不意味着子公司不能付款给母公司，关键在于这种付款行为是否符合合同约定以及相关法律法规的规定。
二、合同约定与付款安排
合同明确约定：如果子公司与合同对方在合同中明确约定了付款方式，包括可以付款给母公司或由母公司代为收款等条款，那么子公司按照合同约定付款给母公司是合法的。
合同未明确约定但双方协商一致：即使合同中没有明确约定付款方式，如果子公司与合同对方在合同履行过程中协商一致，同意由子公司付款给母公司，并且这种变更不违反法律法规的强制性规定，那么这种付款行为也是有效的。
三、法律法规的合规性
税务合规性：子公司付款给母公司时，需要确保税务处理的合规性。例如，如果这种付款被视为利润分配或关联交易，可能需要按照相关税法规定缴纳税款或进行税务申报。
资金流转合规性：子公司付款给母公司还需要确保资金流转的合规性，避免涉及洗钱、资金挪用等违法行为。
四、实际操作中的注意事项
完善内部审批流程：子公司付款给母公司前，应完善内部审批流程，确保付款行为符合公司章程和内部管理制度的规定。
保留相关证据：子公司应保留与付款行为相关的所有证据，包括合同、付款凭证、双方协商一致的书面记录等，以备不时之需。
关注合同对方反应：子公司付款给母公司后，应关注合同对方的反应，确保对方没有提出异议或要求承担违约责任等。
五、可能的风险与后果
如果子公司未经合同对方同意或违反合同约定，擅自将款项支付给母公司，可能面临以下风险和后果：
合同对方要求承担违约责任：合同对方可能依据合同约定要求子公司承担违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。
损害公司信誉和形象：这种行为可能损害子公司的信誉和形象，影响其与合同对方及其他合作伙伴的关系。
法律纠纷和诉讼：在极端情况下，这种行为可能引发法律纠纷和诉讼，给子公司带来不必要的法律风险和成本。
总结与建议：子公司签署合同后付款给母公司，在符合合同约定和法律法规规定的前提下是可行的。但为了避免潜在的风险和后果，建议子公司在付款前与合同对方进行充分沟通并达成一致意见，同时完善内部审批流程和保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。