公司用发票抵税的合法性需分情况讨论，关键在于发票的真实性、与公司业务的关联性以及是否符合相关法规要求。以下从合法与不合法两种情况为你详细分析：
一、合法情况
真实业务关联：
- 若公司使用的发票是基于真实的业务活动产生的，比如公务出差的差旅费（机票、火车票、住宿费等）、业务招待的餐饮费、为公司采购的办公用品等，并且这些费用符合公司的报销规定和税法要求，那么公司可以将这些发票作为合法有效的凭证进行账务处理和税务抵扣。
- 例如，公司员工因公务出差产生了住宿费，并取得了正规发票，公司审核无误后，可以用该发票进行税务抵扣，这是完全合法的。
合规操作：
- 公司必须确保报销流程合规，包括审核发票的真实性、合理性以及与公司业务的关联性。同时，公司应遵守税法规定，正确计算应纳税所得额，并按时申报纳税。
- 例如，公司建立了完善的报销制度，要求员工提供发票时必须附上相关的业务说明或审批单，以确保发票的真实性和合规性。
二、不合法情况
虚开发票：
- 如果公司使用的发票是通过非法手段取得的，如购买假发票或在没有真实交易的情况下开具发票（即虚开发票），那么这种行为就是违法的。
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》，虚开发票属于严重的税务违法行为，公司将面临补缴税款、罚款、滞纳金等处罚，甚至可能追究刑事责任。
与业务无关的个人消费：
- 如果公司使用的发票是个人消费产生的，如个人购物、餐饮、娱乐等，与公司业务无关，那么公司不能使用这些发票进行税务抵扣。
- 税法明确规定，只有与企业取得收入相关的、合理的支出才可以在计算应纳税所得额时扣除。例如，员工用个人消费的发票来报销，公司却用这些发票进行税务抵扣，这是违法的。
侵犯劳动者权益：
- 如果公司要求员工提供发票抵税，实际上是在变相克扣员工工资或福利，这也是违反《中华人民共和国劳动法》的行为。
- 公司应尊重员工的合法权益，不得无故克扣员工工资或要求员工承担本应由公司承担的税费。例如，公司要求员工每月提供一定金额的发票来抵税，否则就扣减工资，这是不合法的。
三、建议与注意事项
- 建立完善的报销制度：公司应建立完善的报销制度和流程，确保发票的真实性和合理性。对员工进行税法培训，提高员工的税收法律意识。
- 咨询专业机构：虽然我作为武侠律师可以为你提供专业的法律咨询，但税务问题有时较为复杂，公司也可以咨询专业税务机构，确保税务处理的合规性。
- 遵守劳动法规定：公司应遵守劳动法规定，保障员工的合法权益，不得变相克扣员工工资或福利。
总之，公司在使用发票进行税务抵扣时，应谨慎行事，确保操作的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。