农村自建房协议书在满足一定条件下是具有法律效力的。以下是对这一问题的详细分析：
一、协议有效的一般条件
行为人具有相应的民事行为能力：
- 协议双方，即建房人和施工方（或承包人），必须具备完全民事行为能力。这意味着他们必须是年满18周岁且精神正常的自然人，或者依法成立并具有相应资质的法人或其他组织。这是协议有效的基本前提。
意思表示真实：
- 协议内容必须反映双方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。双方应在平等、自愿的基础上签订协议，确保协议条款是双方协商一致的结果。
不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：
- 协议内容必须合法合规，不得损害国家、集体和他人权益，也不得违反社会公共秩序和善良风俗。例如，协议中不得约定在禁止建房的耕地上建房，或者进行其他非法活动。
符合法定形式：
- 虽然农村自建房协议不一定要求严格的法定形式，但为了确保协议的明确性和可执行性，建议采用书面形式签订。书面协议应详细约定建房的各项具体内容，如建房地点、面积、层数、结构形式、装修标准、工程价款及支付方式、工期等，并由双方签字或盖章确认。
二、农村自建房协议特有的法律要求
宅基地相关规定：
- 协议涉及宅基地使用时，必须符合“一户一宅”原则，且面积不得超过规定标准。同时，宅基地的使用需符合乡（镇）土地利用总体规划和村庄规划，不得占用永久基本农田。
建设规划许可：
- 自建房前需取得乡村建设规划许可证等相关许可。协议中可约定建房方有义务办理相关手续，未取得合法许可进行建设的，可能面临违建拆除等法律后果。
三、协议无效或可撤销的情形
协议无效的情形：
- 如果协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，那么该协议将被认定无效。例如，协议中约定在耕地上建房，或者进行其他非法活动，这样的协议是无效的。
协议可撤销的情形：
- 如果一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下签订协议，那么受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销该协议。
四、法律建议
签订协议前进行充分沟通：
- 在签订农村自建房协议前，双方应进行充分的沟通，明确各自的权利和义务，确保协议条款是双方协商一致的结果。
咨询专业律师或相关部门：
- 由于农村自建房涉及宅基地使用、建设规划许可等复杂法律问题，建议在签订协议前咨询专业律师或相关部门，以确保协议的合法性和有效性。
保留相关证据：
- 在签订和履行协议过程中，双方应保留好相关证据，如协议文本、付款凭证、施工记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
举例说明：假设甲和乙签订了一份农村自建房协议，约定甲提供宅基地，乙负责建房。在签订协议前，双方应确认甲对宅基地拥有合法使用权，且乙具备相应的建房资质。同时，协议中应明确建房的具体要求、工程价款及支付方式、工期等条款。如果协议内容合法合规，且双方意思表示真实，那么该协议是具有法律效力的。
综上所述，农村自建房协议书在满足一定条件下是具有法律效力的。为了确保协议的合法性和有效性，建议在签订协议前进行充分沟通、咨询专业律师或相关部门，并保留好相关证据。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。