在处理寻衅滋事案件时，如果案件已经结束但主犯或其他关键嫌疑人未到案，司法机关会采取一系列全面且系统的措施来确保案件的公正处理。以下是对这一情境的详细解答：
一、总体原则
首先，需要明确的是，寻衅滋事罪是独立的犯罪行为，每个人的责任需单独承担。主犯的未到案，并不影响对已到案犯罪嫌疑人的处理。司法机关会依据已有证据和法律规定，独立、公正地对每个犯罪嫌疑人进行审判和量刑。
二、侦查阶段的措施
通缉与追捕：
- 公安机关会发布通缉令，通过广播、电视、报刊、计算机网络等媒体广泛传播，借助社会力量追捕未到案的主犯。
- 通缉令的发布根据管辖范围决定，县级以上公安机关可直接在其管辖区内发布，超出范围则需报请上级公安机关。
继续侦查与收集证据：
- 即使主犯未到案，公安机关仍会继续调查，梳理并深化已掌握的证据。
- 这包括对目击证人的再次询问、监控视频的分析、物证的鉴定等，以查清案件事实，确保证据的完整性、确凿性。
三、审查起诉阶段的处理
分案处理：
- 如果其他犯罪嫌疑人的犯罪事实已查清，证据确实充分，人民检察院可对已到案的犯罪嫌疑人先行提起公诉，对在逃主犯另案处理。
- 这保证了诉讼程序的正常进行，避免了因主犯未到案而导致的案件拖延。
持续追逃与证据审查：
- 检察机关会关注主犯的追捕情况，督促公安机关继续追逃。
- 同时，对已有证据进行严格审查，确保证据的合法性、真实性和关联性，为后续可能的起诉做好准备。
四、审判阶段的考量
对已到案被告人的审判：
- 法院会根据查明的事实和证据，依法对已到案的被告人进行审判。
- 在量刑时，会综合考虑各被告人在犯罪中的作用和地位，对从犯依法从轻、减轻或免除处罚。
主犯到案后的处理：
- 当主犯到案后，司法机关将按照正常诉讼程序对其进行侦查、审查起诉和审判。
- 在审判过程中，会将主犯的犯罪行为与之前已判决的从犯行为进行综合考量，确保量刑的公正平衡。
- 如发现之前对从犯的量刑存在明显不合理，可能会启动审判监督程序进行纠正。
五、特殊情况的处理
- 如果主犯一直未能到案，且证据不够充分或直接证明其罪行存在困难，司法机关仍将根据已有证据和法律规定，尽可能还原案件事实，并作出公正裁决。这可能包括对已到案被告人的量刑调整，或者对案件进行其他适当的处理。
六、法律意义与社会价值
寻衅滋事是严重的违法犯罪行为，不仅伤害受害者，还破坏社会秩序和公共安全。司法机关采取的上述措施，体现了法律的严肃性和公正性，同时也强调了每个人应为自己的犯罪行为承担法律责任的重要性。
七、建议与帮助
如果您或他人涉及此类案件，且对案件处理有疑虑或担忧，建议咨询专业法律人士以获得更具体的建议和帮助。他们可以根据案件的具体情况，提供针对性的法律意见和指导。
综上所述，即使寻衅滋事案件的主犯未到案，司法机关也会通过一系列严谨而有效的措施，确保案件的公正、及时处理，维护社会的和谐与稳定。