核心结论：若贷款合同中标注借款人办理不动产证时需将相关材料交上，但材料已交且可能影响自身权益，可先与贷款方沟通协商，协商不成可根据具体情况通过法律途径解决。以下是详细分析：

从协商解决角度

1. 沟通协商的必要性：当发现不动产证相关材料已经交上去，而自己又担心可能存在风险或者有特殊需求时，首先应该与贷款方进行友好且诚恳的沟通。向贷款方说明自己的情况，例如交材料时可能存在的误解、自己后续对不动产证的使用需求等。
2. 协商的内容方向：可以协商能否复印相关材料留存备用，或者协商在不影响贷款合同履行和贷款方权益的前提下，对材料的保管和使用方式达成新的共识。比如，约定在特定情况下自己可以取回材料使用，使用完毕后再交回贷款方保管。

从法律途径角度

1. 审查合同条款：仔细审查贷款合同中关于交不动产证材料这一条款的具体内容。看是否有明确约定材料的归还时间、归还条件以及双方的权利义务等。如果合同条款存在模糊不清或者显失公平的地方，这可能成为后续维权的一个切入点。例如，合同只规定了借款人要交材料，但没有规定贷款方在何种情况下要归还材料，那么借款人可以依据公平原则等法律理念与贷款方理论。
2. 依据法律规定主张权利
   • 物权法相关规定：不动产证是证明不动产所有权的重要凭证，借款人对不动产依然享有物权。如果贷款方无正当理由扣留不动产证材料，影响了借款人对不动产的正常使用、处分等权利，借款人可以依据物权法的相关规定，要求贷款方返还材料或者承担相应的法律责任。
   • 合同法相关规定：贷款合同是双方意思表示一致的协议，双方都应当按照合同约定履行义务。如果贷款方在接收材料后，没有按照合同约定或者诚实信用原则妥善保管和使用材料，给借款人造成了损失，借款人可以依据合同法的规定，要求贷款方赔偿损失。例如，贷款方将材料丢失，导致借款人无法正常办理不动产的相关手续，借款人可以要求贷款方赔偿因此产生的直接和间接损失。
3. 收集证据：如果要通过法律途径解决，收集证据是关键。要收集贷款合同、交材料时的相关凭证（如交接单、签字记录等）、与贷款方沟通协商的记录（如聊天记录、通话录音等）以及因材料交上去而给自己造成损失的证据（如因无法及时办理不动产过户而产生的额外费用发票等）。
4. 选择合适的维权方式：根据具体情况，可以选择向法院提起诉讼或者向相关的仲裁机构申请仲裁。如果合同中有仲裁条款，约定了发生争议通过仲裁解决，那么就需要向约定的仲裁机构申请仲裁；如果没有仲裁条款，则可以直接向有管辖权的法院提起诉讼。