合同诈骗在立案后退赔全部金额，并不意味着可以直接撤案。是否撤案需根据案件的具体情况及所处的法律阶段来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、撤案的法律依据与条件
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：若合同诈骗行为虽存在，但情节显著轻微，未造成严重后果，不构成犯罪，公安机关可依法撤案。然而，退赔全部金额并不直接等同于情节显著轻微，还需结合其他因素综合判断。
犯罪已过追诉时效期限：合同诈骗罪的追诉时效根据法定最高刑确定。若犯罪行为发生时间久远，已超过追诉时效，公安机关应撤案。退赔金额与追诉时效无关。
经特赦令免除刑罚：若犯罪嫌疑人被特赦，依法不再追究刑事责任，公安机关应撤案。退赔金额不是特赦的考虑因素。
犯罪嫌疑人死亡：犯罪嫌疑人死亡的，刑事责任自然终止，公安机关应撤案。退赔金额在此情况下无意义。
其他法律规定免予追究刑事责任的情形：如犯罪嫌疑人自首且有重大立功表现等，可能依法免予追究刑事责任，导致撤案。退赔金额可能作为量刑情节考虑，但非撤案的直接依据。
二、退赔金额对案件处理的影响
退赔全部金额虽然不能直接导致撤案，但可以作为量刑情节在审判阶段考虑。如果犯罪嫌疑人能够积极退赔，获得被害人的谅解，法院在量刑时可能会酌情从轻处罚。这并不意味着案件会被撤销，而是对犯罪嫌疑人刑罚轻重的影响。
三、撤案的程序要求
撤案需经过严格的内部审批程序，确保决策合法合规。公安机关在决定撤案前，会综合考虑案件的性质、情节、社会影响以及退赔情况等因素。即使退赔了全部金额，如果案件性质严重，社会影响恶劣，公安机关也可能不会撤案。
四、实际操作中的建议
积极配合调查：如果涉嫌合同诈骗，应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据材料。
考虑退赔与谅解：在可能的情况下，积极退赔被害人的损失，并争取获得被害人的谅解。这有助于在量刑时获得从轻处罚的机会。
咨询专业律师：在处理此类案件时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据案件的具体情况，提供有针对性的法律建议和辩护策略。
总结来说，合同诈骗立案后退赔全部金额并不能直接导致撤案。是否撤案需根据案件的具体情况及所处的法律阶段来判断。如果面临此类情况，建议积极配合调查，考虑退赔与谅解，并咨询专业律师的意见。