民事案件执行协商好了并不意味着就一定结案了，这取决于协商的具体内容和执行阶段的进展情况。以下从不同角度为你详细分析：
协商内容达成执行和解：
- 如果双方在执行过程中达成了执行和解协议，并且该协议得到了法院的认可，那么案件可能会进入一个暂时的中止执行阶段。但这并不意味着案件已经结案，因为和解协议的执行情况还需要进一步观察。
- 如果和解协议得到完全履行，即被执行人按照协议约定履行了全部义务，那么案件可以视为执行完毕，法院会作出结案裁定。
- 如果和解协议没有得到履行，或者部分履行但剩余部分无法继续履行，申请执行人可以向法院申请恢复原生效法律文书的执行，此时案件会继续执行程序，直至执行完毕或达到其他终结条件。
协商内容涉及执行终结的其他情形：
- 除了执行和解外，民事案件执行还可能因其他原因而终结，如申请执行人撤销申请、据以执行的法律文书被撤销、被执行人死亡且无遗产可供执行等。
- 如果协商的内容涉及这些执行终结的情形，并且得到了法院的确认，那么案件可能会直接结案。但这种情况相对较少，且需要严格的法律程序和证据支持。
协商后未达成正式协议或协议未获法院认可：
- 如果双方虽然进行了协商，但未能达成正式的执行和解协议，或者达成的协议未获得法院的认可，那么案件将继续按照原生效法律文书进行执行。
- 在这种情况下，协商的结果对案件的结案没有直接影响，案件的结案将取决于执行程序的进展和结果。
法律建议：
- 在执行过程中进行协商时，建议双方明确协商的内容和目的，并尽量达成书面协议。如果可能的话，可以请法院对协议进行审查和确认，以确保其法律效力和可执行性。
- 如果协商后案件进入中止执行阶段，申请执行人应密切关注被执行人的履行情况，并在必要时及时向法院申请恢复执行。
- 如果对执行程序或协商结果有任何疑问或担忧，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助和指导。
可能后果：
- 如果协商后案件未能顺利结案，申请执行人可能需要继续投入时间和精力来推动执行程序的进展。
- 如果被执行人未能履行和解协议或其他义务，申请执行人可能需要通过法律途径来维护自己的合法权益，这可能会增加诉讼成本和时间成本。
总之，民事案件执行协商好了并不一定就意味着结案，具体情况需要根据协商的内容和执行阶段的进展来判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。