判决后，双方协商一致是可以结案的，但具体结案方式需根据案件类型和协商内容来确定。以下从不同角度进行详细分析：

一、民事案件中的协商结案

在民事案件中，判决后双方当事人如果达成和解协议，即协商一致，是可以通过一定程序来结案的。这通常涉及以下几个步骤：

1. 达成和解协议：双方当事人在判决后，可以就案件的执行、赔偿等事项进行协商，并达成书面和解协议。
2. 申请结案：达成和解协议后，一方或双方当事人可以向法院提交结案申请，附上和解协议作为证据。
3. 法院审查与确认：法院会对和解协议进行审查，确认其合法性和有效性。如果和解协议符合法律规定，法院会出具结案裁定或通知，正式结案。

法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人有权在法律规定的范围内处分自己的民事权利和诉讼权利。因此，双方当事人在判决后达成和解协议，是合法且有效的结案方式。

二、刑事案件中的协商结案（以刑事和解为例）

在刑事案件中，虽然判决后直接协商结案的情况较为少见，但存在刑事和解的制度。刑事和解是指在刑事诉讼过程中，通过调停人或其他组织使被害人与犯罪嫌疑人、被告人直接沟通、共同协商，双方达成民事赔偿和解协议后，司法机关根据案件的具体情况对犯罪嫌疑人、被告人不再追究刑事责任或从轻减轻刑事责任的诉讼活动。然而，刑事和解通常适用于刑事诉讼过程中的特定阶段，而非判决后。但值得注意的是，如果判决后被告人积极履行赔偿义务，与被害人达成和解，这可能作为量刑时的从轻情节考虑，但并不直接导致结案。

特殊情况：在部分轻微刑事案件中，如自诉案件，如果双方当事人在判决后达成和解，自诉人可以撤回自诉，从而结案。但这需要符合法律规定的撤诉条件，并经过法院审查同意。

三、行政案件中的协商结案

在行政案件中，判决后双方协商一致结案的情况相对复杂。行政案件通常涉及行政机关与公民、法人或其他组织之间的争议。虽然行政机关与相对人之间可以就争议事项进行协商，但行政案件的结案通常需要遵循严格的法律程序和规定。如果双方当事人在判决后达成和解协议，并希望以此结案，可能需要向法院提交申请，并经过法院审查确认后才能正式结案。

四、注意事项与建议

1. 合法性审查：无论何种类型的案件，双方当事人在协商结案时，都应确保和解协议的合法性和有效性。避免违反法律、行政法规的强制性规定或损害国家、集体、第三人的利益。
2. 书面协议：建议双方当事人将协商内容以书面形式固定下来，作为结案的依据。这有助于减少后续争议和纠纷。
3. 法院审查：在提交结案申请时，应附上和解协议等证据材料，以便法院进行审查。法院的审查是确保结案合法性和有效性的重要环节。

总结：判决后双方协商一致是可以结案的，但具体结案方式需根据案件类型和协商内容来确定。在民事案件中，双方可以通过达成和解协议并申请结案；在刑事案件中，虽然判决后直接协商结案的情况较少见，但存在刑事和解等制度；在行政案件中，结案需要遵循严格的法律程序和规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。