非法占用土地处罚后是否可以补办手续，需分情况讨论，具体如下：

1. 若非法占用土地行为未造成严重后果，且符合土地利用总体规划和城乡规划
   根据《土地管理法》第七十七条及《城乡规划法》第六十四条，若非法占用土地行为未严重破坏耕地、未导致土地资源不可逆损害，且占用行为符合土地利用总体规划和城乡规划，行政机关在作出处罚（如责令退还土地、限期拆除或没收地上建筑物、罚款等）后，可依法补办用地审批手续。
   例如：企业因未及时办理用地手续占用集体土地建设厂房，若土地符合规划且未破坏耕地，在接受罚款、退还部分非法占用土地等处罚后，可向自然资源部门申请补办农用地转用审批或集体建设用地使用手续。

2. 若非法占用土地行为造成严重后果，或不符合土地利用总体规划和城乡规划
   若非法占用土地行为导致耕地严重破坏、生态功能丧失，或占用土地属于永久基本农田、生态保护红线等禁止建设区域，根据《土地管理法》第七十七条及《刑法》第三百四十二条（非法占用农用地罪），不仅无法补办手续，还可能面临刑事责任。
   例如：个人未经批准占用永久基本农田建设住宅，即使后续拆除建筑物并恢复土地原状，因土地性质为永久基本农田，仍无法补办用地手续，且可能因“非法占用农用地罪”被追究刑事责任。

3. 特殊情形：历史遗留问题或政策调整
   对于因历史原因形成的非法占地问题（如早期农村宅基地未批先建），部分地区可能通过“历史遗留问题处理政策”允许补办手续，但需满足以下条件：

   • 占用行为发生在特定时间节点前（如2019年《土地管理法》修订前）；
     
   • 符合现行土地利用总体规划和城乡规划；
     
   • 经村民会议或村民代表会议同意，并公示无异议。
     此类情形需以地方政策为准，建议向当地自然资源部门咨询具体操作流程。

行动建议：

• 若您或您的企业涉及非法占地问题，首先需确认占用土地的性质（如是否为耕地、永久基本农田）、是否符合规划，可通过当地自然资源部门官网或现场查询土地利用总体规划图；
  
• 若符合补办条件，需在行政处罚决定书规定的期限内履行处罚义务（如缴纳罚款、退还土地），随后向自然资源部门提交用地申请材料；
  
• 若不符合补办条件，建议尽快拆除地上建筑物、恢复土地原状，以避免进一步法律风险。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我将结合地方政策及司法实践为您提供针对性建议。