工伤职工未在协议机构就医，可能会面临以下后果：

1. 医疗费用报销受限：

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤职工应当到签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。若未在协议机构就医，且未经社会保险经办机构同意，其医疗费用可能无法从工伤保险基金中支付，需要由工伤职工自行承担。
   • 法律依据：《工伤保险条例》第三十条：“治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。…职工治疗工伤应当在签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。”

2. 影响工伤认定和伤残等级鉴定：

   • 未在协议机构就医可能影响工伤认定的流程和结果。因为协议机构通常与社保部门有合作关系，能够提供更规范、更全面的医疗记录和诊断证明，这些对于工伤认定和伤残等级鉴定至关重要。
   • 若因未在协议机构就医导致医疗记录不完整或诊断证明不明确，可能会增加工伤认定和伤残等级鉴定的难度，甚至可能导致认定或鉴定结果不利于工伤职工。

3. 可能面临社保部门的调查和审核：

   • 社保部门在审核工伤医疗费用时，会对就医机构进行核实。若发现工伤职工未在协议机构就医，且未经批准，社保部门可能会进行调查，要求工伤职工提供合理的解释和证明。
   • 若工伤职工无法提供充分的证明或解释，社保部门可能会拒绝支付相关医疗费用，甚至可能对工伤职工进行处罚。

4. 影响后续的工伤赔偿：

   • 工伤赔偿的数额和范围通常与工伤认定和伤残等级鉴定结果密切相关。若因未在协议机构就医导致工伤认定或伤残等级鉴定结果不利，将直接影响工伤职工后续的赔偿数额和范围。
   • 示例：若工伤职工因未在协议机构就医导致伤残等级鉴定结果偏低，那么其应获得的伤残补助金、医疗补助金等赔偿项目数额也会相应减少。

建议：

• 工伤职工在发生工伤后，应尽快到签订服务协议的医疗机构就医，并按照规定程序进行工伤认定和伤残等级鉴定。
• 若因情况紧急需要先到就近的医疗机构急救，也应在病情稳定后及时转到协议机构继续治疗，并保留好相关医疗记录和诊断证明。
• 如有任何疑问或需要帮助，工伤职工可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。