结论：公诉人未将他们制作的讯问笔录入目录入起诉卷，这一行为本身并不直接等同于违法，但可能违反了相关的诉讼程序规定或检察机关的内部办案规范，具体是否违法需结合实际情况判断。

分析：

1. 诉讼程序规定：

   • 在刑事诉讼中，讯问笔录是重要的证据材料，它记录了侦查人员对犯罪嫌疑人的讯问过程及犯罪嫌疑人的供述和辩解。
   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，讯问笔录应当作为案件材料的一部分，随案移送至检察机关，并在起诉时一并提交给法院。
   • 然而，法律并未明确规定讯问笔录必须“入目录”或“以特定形式入卷”，而是强调了其作为证据材料的重要性和随案移送的必要性。因此，如果讯问笔录已经随案移送，但未被明确列入起诉卷的目录中，这更多可能是一个程序上的瑕疵，而非直接的违法行为。

2. 检察机关内部办案规范：

   • 检察机关在办理案件时，通常会制定一系列内部办案规范，以确保案件的办理质量和效率。
   • 这些规范可能包括对案件材料的整理、归档和提交的具体要求，如讯问笔录应当如何入卷、如何编号、如何列入目录等。
   • 如果公诉人未按照这些内部规范操作，虽然可能不构成直接的违法行为，但可能违反了检察机关的内部纪律或规定，需要接受相应的内部监督或处理。

3. 实际影响与后果：

   • 讯问笔录未入目录入起诉卷，可能对案件的审理产生一定影响，如法院在审查案件时可能难以快速找到相关证据材料。
   • 但这种影响通常可以通过补正、说明或提供其他辅助材料来消除，并不必然导致案件的审理受阻或结果的不公。
   • 如果因此导致了严重的程序错误或影响了案件的公正审理，相关责任人员可能需要承担相应的法律责任或纪律处分。

建议：

• 如果您是案件的当事人或辩护人，发现公诉人未将讯问笔录入目录入起诉卷，您可以及时向检察机关提出异议，要求其补正或说明情况。
• 如果您认为这一行为已经影响了案件的公正审理，您还可以向法院提出申请，要求法院对相关证据材料进行审查或要求检察机关提供完整的案件材料。
• 在任何情况下，都建议您保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益，避免采取过激或违法的行为。

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