针对您提出的“非农户口承包村集体荒地被征收，第三方评估公司是否评估经营权预期收益”的问题，这涉及到多个法律层面和实际操作环节，下面我将为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，土地补偿费是对土地所有权人的补偿。根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，农村荒地属于村集体所有，并非农民个人所有。因此，当荒地被征收时，土地补偿款应归农村集体经济组织所有，由农村集体经济组织按照法律规定的民主议定程序决定在本集体经济组织内部进行分配。

接下来，关于您提到的“经营权预期收益”的评估问题。这通常涉及到承包户在剩余承包期限内因土地被征收而无法继续承包经营的损失。虽然土地补偿款本身归村集体所有，但承包户因土地被征收造成的经营损失，是有权要求给予适当补偿的。这种补偿可能不是直接以“经营权预期收益”的名义进行，但会考虑到承包户在剩余承包期内的潜在收益损失。

至于第三方评估公司是否会对“经营权预期收益”进行评估，这主要取决于征收方与承包户之间的协商和征收补偿方案的具体规定。在实际操作中，为了公平、合理地确定补偿金额，征收方可能会委托第三方评估公司对承包户的经营损失进行评估。这种评估会综合考虑多种因素，如承包地的地理位置、土壤质量、剩余承包期限、承包户的实际投入和预期收益等。

然而，并非所有情况下都会进行这样的评估。如果征收补偿方案中没有明确规定需要对“经营权预期收益”进行评估，或者承包户与征收方能够就补偿金额达成一致意见，那么可能就不需要进行专门的评估。

最后，我想强调的是，非农户口承包村集体荒地的情况在法律上可能存在一定的特殊性。虽然您可能通过合法方式承包了荒地并进行了经营投入，但您的户口性质（非农户口）可能会影响到您在征收补偿中的权益。因此，在处理这类问题时，建议您咨询专业的法律人士或律师，以便更好地维护自己的合法权益。

综上所述，第三方评估公司是否会对“经营权预期收益”进行评估取决于多种因素，包括征收补偿方案的规定、承包户与征收方的协商结果以及实际情况的需要等。希望这些解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。