结论：施工单位与建设单位结算达成以房抵工程款后，在一定条件下仍然可以向法院起诉要求支付工程款。以下从不同角度进行分析：

1. 合同履行与变更角度：

   • 如果双方签订的以房抵工程款协议是真实、合法、有效的，并且已经实际履行（例如，房屋已经过户至施工单位名下），那么从合同履行的角度来看，建设单位已经通过房屋抵偿了工程款，施工单位再要求支付工程款可能缺乏法律依据。
   • 但是，如果以房抵工程款协议存在无效情形（如欺诈、胁迫、恶意串通损害国家、集体或第三人利益等），或者协议虽然签订但并未实际履行（如房屋未过户、未交付等），那么施工单位仍然有权依据原建设工程施工合同向法院起诉要求支付工程款。

2. 协议内容与约定角度：

   • 如果以房抵工程款协议中明确约定了“在房屋交付或过户后，施工单位不得再就工程款向建设单位主张权利”等类似条款，那么施工单位在协议履行后通常不能再要求支付工程款。
   • 然而，如果协议中并未明确排除施工单位就工程款向法院起诉的权利，或者协议存在模糊、歧义等情况，那么施工单位在特定条件下（如房屋存在质量问题、协议履行存在障碍等）仍然有可能向法院起诉要求支付工程款。

3. 法律救济与权利保护角度：

   • 即使双方已经签订了以房抵工程款协议，但如果施工单位认为该协议存在不公平、不合理之处，或者建设单位存在违约行为（如未按照协议约定交付房屋、房屋存在权利瑕疵等），施工单位仍然有权通过法律途径维护自己的合法权益。
   • 在这种情况下，施工单位可以向法院起诉要求撤销或变更以房抵工程款协议，或者要求建设单位承担违约责任并支付相应的工程款。

法律建议：

• 施工单位在签订以房抵工程款协议前，应仔细审查协议内容，确保协议真实、合法、有效，并明确双方的权利义务。
• 如果协议签订后出现争议或问题，施工单位应及时咨询专业律师，了解自己的法律权利和义务，并根据实际情况选择合适的法律途径维护自己的合法权益。
• 在诉讼过程中，施工单位应提供充分的证据证明自己的主张，如建设工程施工合同、以房抵工程款协议、房屋交付或过户证明等。

可能的法律后果：

• 如果施工单位能够提供充分的证据证明自己的主张，并且法院认定其诉讼请求成立，那么建设单位可能需要支付相应的工程款及利息等费用。
• 如果施工单位无法提供充分的证据或者法院认定其诉讼请求不成立，那么施工单位可能需要承担败诉的风险，并可能面临诉讼费用等经济损失。