结论：公司因员工欠公司钱而直接扣工资的行为，一般是不合法的。但具体是否合法，需根据实际情况和法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、直接扣工资的违法性
根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。公司不得随意克扣或无故拖欠劳动者的工资。如果公司因为员工欠公司钱而直接扣工资，这通常被视为克扣工资的行为，是违法的。
二、合法扣款的特殊情况
尽管直接扣工资一般不合法，但也存在一些特殊情况，公司可以在符合法律规定的前提下进行扣款。例如：
代扣代缴义务：如果员工欠公司的款项属于应当由公司代扣代缴的税费、社会保险费等，公司可以按照法律规定进行代扣代缴。但这种情况下的扣款必须严格遵循相关法律法规的规定，不能随意扩大扣款范围或提高扣款比例。
员工同意：如果员工明确同意公司从其工资中扣除欠款，并且这种同意是在自愿、平等、协商一致的基础上达成的，那么公司可以在员工同意的范围内进行扣款。但公司应当确保员工的同意是真实有效的，并且扣款金额和方式应当合理合法。
三、公司的法律责任
如果公司违法扣款，将承担以下法律责任：
行政责任：劳动行政部门有权责令公司限期支付拖欠的工资（即被扣的工资）。若逾期仍不支付，公司需按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
经济责任：除支付拖欠的工资外，公司还需承担因违法扣款给劳动者造成的其他经济损失赔偿责任。
四、劳动者的维权途径
面对公司违法扣款的情况，劳动者可以积极通过以下途径维护自身权益：
协商：首先尝试与公司沟通，明确指出违法扣款问题，并要求其尽快支付被扣的工资。协商过程中应保留好相关沟通记录，以备后续使用。
投诉：若协商无果，劳动者可携带能证明劳动关系及违法扣款事实的材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、扣款通知等，前往当地劳动监察大队投诉。劳动监察部门会依法进行调查处理，并责令公司支付被扣的工资。
仲裁：若投诉仍未解决问题，劳动者可在劳动争议发生之日起一年内，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁过程中，劳动者需提交充分的证据材料，以支持自己的主张。对仲裁结果不满意的，还可在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
诉讼：作为维权的最后手段，劳动者可通过司法途径解决纠纷，追讨被扣的工资。在诉讼过程中，劳动者需遵循法律程序，积极举证，争取自身的合法权益。
建议：如果你遇到了公司违法扣款的情况，建议先与公司进行协商，尝试解决问题。如果协商无果，可以及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。