结论：没有林权证，仅凭少数村民签字来办理不动产权，这种行为的合法性不能一概而论，需要分情况讨论。
合法性的一般原则：
- 在我国，不动产权的设立、变更、转让和消灭，通常需要依法进行登记，并取得相应的不动产权证书。对于林权而言，林权证是证明林权归属的重要法律文件。
- 如果仅凭少数村民的签字，而没有其他合法有效的证明文件（如林权证、合法的转让协议等），来办理不动产权登记，这通常是不符合法律规定的。因为少数村民的签字并不能代表所有相关权利人的意愿，也无法证明林权的真实归属。
特殊情况下的合法性：
- 如果存在特殊情况，比如该林地原本就没有颁发过林权证，或者林权证已经遗失、损毁，且能够通过其他方式（如历史档案、村民大会决议等）证明林权的归属，同时少数村民的签字是代表全体村民或相关权利人的真实意愿，并且得到了相关部门的认可，那么在这种情况下，仅凭少数村民签字办理不动产权登记可能是合法的。但这种情况非常特殊，且需要严格的证明和审批程序。
可能的法律后果：
- 如果未经合法程序，仅凭少数村民签字就办理了不动产权登记，这可能会引发法律纠纷。其他相关权利人（如未签字的村民、林地的实际使用者等）可能会对此提出异议，甚至提起诉讼要求撤销该登记。
- 此外，如果这种行为被认定为违法，相关责任人（如办理登记的人员、签字的村民等）还可能面临法律责任，包括行政处罚或民事赔偿等。
建议：
- 在办理不动产权登记时，务必确保所有相关权利人的意愿得到充分表达和尊重，并取得合法有效的证明文件。
- 如果对林权的归属存在争议或疑问，建议先通过协商、调解或诉讼等方式解决争议，明确林权的归属后再进行登记。
- 在整个过程中，可以寻求专业律师的帮助，以确保所有行为的合法性和有效性。
总结：没有林权证，仅凭少数村民签字来办理不动产权登记，其合法性取决于具体情况和证明文件的充分性。在大多数情况下，这种行为可能是不合法的，并可能引发法律纠纷。因此，在办理此类登记时，务必谨慎行事，并确保所有程序的合法性和有效性。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。