结论前置：劳务派遣合同签订两年以上，并不与劳务派遣不超过六个月的短期派遣相矛盾。这是因为两年以上的合同期限是法律对劳务派遣单位与被派遣劳动者之间劳动合同的最低要求，旨在保障被派遣劳动者的就业稳定性和合法权益；而劳务派遣不超过六个月，则通常指的是具体派遣任务的期限，两者针对的是不同的法律关系和时间维度。
详细分析：
法律规定与合同期限：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条的规定，劳务派遣单位应当与被派遣劳动者订立二年以上的固定期限劳动合同。这一规定是法律对劳务派遣单位与被派遣劳动者之间劳动合同期限的明确要求，旨在防止劳务派遣单位通过短期合同随意辞退劳动者，从而损害其权益。
- 两年以上的合同期限，为被派遣劳动者提供了相对稳定的职业环境，减少了因合同频繁到期而带来的就业不确定性，有助于劳动者安心工作，提高工作积极性和效率。
劳务派遣期限与合同期限的区别：
- 劳务派遣期限，通常指的是被派遣劳动者在用工单位实际工作的期限，这个期限可能因具体任务的需要而有所不同，有的可能较短，如不超过六个月，有的则可能较长。
- 而劳动合同期限，则是劳务派遣单位与被派遣劳动者之间约定的整个劳动关系的存续时间，这个时间通常较长，以保障劳动者的就业稳定性。
- 因此，劳务派遣期限不超过六个月，并不意味着劳动合同期限也只能是六个月或更短。实际上，即使劳务派遣期限较短，劳动合同期限仍然可以按照法律规定签订两年以上。
保障被派遣劳动者的权益：
- 两年以上的劳动合同期限，确保了劳动者在较长时间内享有稳定的收入和社会保障，如工资、社会保险等。
- 若派遣期限届满且没有新的派遣岗位，劳务派遣单位仍需按月支付报酬，进一步保障了劳动者的经济权益。
- 此外，长期合同还有助于促进劳动者的长期职业规划和发展，提高其职业满意度和忠诚度。
实际操作中的灵活性：
- 尽管法律规定了最低两年的合同期限，但在实际操作中，合同的具体期限仍可由派遣单位、用工单位和劳动者三方协商确定。
- 这种灵活性既保证了法律的严格执行，又满足了不同企业和劳动者的实际需求。例如，对于某些需要长期稳定劳动力的用工单位，可以与劳务派遣单位协商签订更长期的劳动合同；而对于某些临时性、季节性的工作任务，则可以签订相对较短的劳务派遣期限，但劳动合同期限仍然可以保持两年以上。
法律建议：
- 对于劳务派遣单位和用工单位来说，应当严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，确保与被派遣劳动者签订的劳动合同期限符合法律要求。
- 在签订劳动合同时，应当明确约定劳动合同期限、劳务派遣期限、工作内容、工作地点、劳动报酬等关键条款，以避免后续出现纠纷。
- 对于被派遣劳动者来说，应当了解自己的合法权益和劳动合同的相关内容，如遇到违法行为或纠纷时，可以及时向相关部门投诉或寻求法律援助。
总结：劳务派遣合同签订两年以上，并不与劳务派遣不超过六个月的短期派遣相矛盾。两者针对的是不同的法律关系和时间维度，共同构成了劳务派遣制度中保障劳动者权益的重要机制。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。