违章建筑与合法建筑在价值鉴定上的主要区别体现在鉴定依据、鉴定内容、鉴定结果的影响及法律后果等多个方面。以下是对这些区别的详细阐述：

1. 鉴定依据不同：

   • 合法建筑：价值鉴定主要依据建筑物的合法产权证明、建筑规划许可、施工许可等合法文件，以及建筑物的实际状况、市场价值等因素进行。这些文件是建筑物合法性的直接证明，也是价值鉴定的重要依据。
   • 违章建筑：由于违章建筑本身缺乏合法的产权证明和规划、施工许可等文件，其价值鉴定往往无法直接依据这些合法文件进行。鉴定机构在鉴定时，可能更多地依赖于建筑物的实际状况、建造成本、使用年限、市场供需关系等因素，同时还需要考虑违章建筑可能面临的拆除、罚款等法律风险对价值的影响。

2. 鉴定内容不同：

   • 合法建筑：价值鉴定通常包括建筑物的结构安全、使用功能、装修状况、市场价值等多个方面。鉴定机构会对建筑物的各个方面进行全面评估，以确定其整体价值。
   • 违章建筑：由于违章建筑可能存在结构安全隐患、使用功能受限等问题，其价值鉴定在内容上可能更加侧重于建筑物的实际状况、建造成本、使用年限等基础因素。同时，鉴定机构还需要对违章建筑可能面临的法律风险进行评估，以更准确地反映其真实价值。

3. 鉴定结果的影响不同：

   • 合法建筑：价值鉴定结果通常作为房屋买卖、抵押、租赁等交易活动的参考依据，对交易双方的权利义务产生直接影响。同时，合法建筑的价值鉴定结果也是保险公司确定保险金额、赔偿标准等的重要依据。
   • 违章建筑：由于违章建筑本身缺乏合法性，其价值鉴定结果在交易活动中的参考价值相对较低。此外，违章建筑可能面临拆除、罚款等法律风险，这些风险会直接影响其价值鉴定结果。在极端情况下，违章建筑的价值可能被评估为零或负值，以反映其可能面临的法律风险和损失。

4. 法律后果不同：

   • 合法建筑：其价值鉴定结果受法律保护，交易双方应依据鉴定结果履行相应的权利义务。如果一方对鉴定结果有异议，可以通过法律途径进行申诉或诉讼。
   • 违章建筑：由于违章建筑本身违反了法律法规的规定，其价值鉴定结果可能不受法律保护。在面临拆除、罚款等法律风险时，违章建筑的所有者可能需要承担相应的法律责任和损失。

建议：在进行房屋价值鉴定时，应首先确认房屋的合法性。对于合法建筑，可以依据相关法律法规和鉴定标准进行价值鉴定；对于违章建筑，则应谨慎对待其价值鉴定问题，充分考虑其可能面临的法律风险和损失。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。