关于自然资源确权期间第三方测绘时间不计入办理期限的法律依据，主要可从以下角度进行分析：

1. 行政程序中的期限计算原则：

   • 在行政程序中，办理期限的计算通常遵循“实际工作时间”原则，即仅计算行政机关实际进行审查、调查、决定等直接相关的工作时间。第三方测绘作为自然资源确权过程中的一个环节，若其由独立第三方进行，且该测绘工作并非由行政机关直接控制或主导，那么该测绘时间理论上不应计入行政机关的办理期限。
   • 法律依据：虽然直接的法律条文可能并未明确提及“第三方测绘时间不计入办理期限”，但根据《中华人民共和国行政许可法》等相关法律中关于行政程序期限的一般规定，可以合理推断出这一原则。行政机关在办理行政许可等事项时，应合理确定各环节的办理时间，并确保总办理时间在法定期限内。若第三方测绘时间过长且非行政机关所能控制，将其计入办理期限将显失公平。

2. 自然资源确权的具体规定：

   • 自然资源确权是一个涉及多个环节和部门的复杂过程，包括权属调查、地籍测量、成果审核等。在这些环节中，第三方测绘通常作为权属调查或地籍测量的重要组成部分，由具有专业资质的测绘机构进行。
   • 特殊规定：在某些地方性法规或部门规章中，可能明确规定了自然资源确权过程中第三方测绘时间的处理方式。例如，可能规定“第三方测绘时间不计入自然资源确权总办理期限，但行政机关应及时跟进测绘进度，确保整体办理效率”。若存在此类规定，则直接依据该规定执行即可。

3. 实践中的操作建议：

   • 明确约定：在自然资源确权项目中，行政机关应与第三方测绘机构明确约定测绘时间、质量标准等关键条款，并确保这些条款与整体办理期限相协调。同时，行政机关应在合同或协议中明确测绘时间不计入办理期限，以避免后续争议。
   • 及时沟通：行政机关应与第三方测绘机构保持密切沟通，及时了解测绘进度和可能遇到的问题。若测绘时间可能超出预期，行政机关应及时调整整体办理计划，并告知相关权利人。
   • 法律依据的引用：在处理因第三方测绘时间引发的争议时，行政机关应充分引用相关法律、法规和规章中关于行政程序期限、自然资源确权等规定，以支持其不计入办理期限的主张。

总结与建议：

自然资源确权期间第三方测绘时间不计入办理期限，虽无直接明确的法律条文规定，但可根据行政程序中的期限计算原则、自然资源确权的具体规定以及实践中的操作建议进行合理推断。为确保这一原则的有效实施，行政机关应与第三方测绘机构明确约定测绘时间等关键条款，并及时沟通测绘进度。若遇到争议或问题，可直接向我咨询，我将结合具体案情和法律法规提供专业意见。