员工劳动仲裁和申诉在劳动纠纷处理中是两个不同的概念，它们的主要区别体现在性质、受理机构、启动程序、审理程序以及裁决/判决效力等多个方面。以下是对这两者的详细对比分析：

1. 性质与受理机构

   • 劳动仲裁：劳动仲裁是劳动争议的前置程序，具有准司法性质。它由劳动人事争议仲裁委员会负责处理，该委员会由劳动行政部门代表、工会代表和企业方面代表组成，专门处理劳动争议。
   • 申诉（此处假设用户指的是劳动争议诉讼中的上诉或申诉行为，因为通常“申诉”并非劳动纠纷处理的独立程序，而是对已有裁决或判决不服时的救济途径）：若理解为对劳动仲裁裁决不服向法院提起的诉讼，则属于司法程序的一部分，由人民法院的民事审判庭依据法律进行审理和裁判。

2. 启动程序与条件

   • 劳动仲裁：劳动争议发生后，当事人一般必须先向劳动仲裁委申请仲裁，这是提起劳动争议诉讼的前置程序。劳动仲裁有明确的受理范围和条件，如劳动争议必须在规定的时效内提出（通常为一年）。
   • 申诉/诉讼：若对劳动仲裁裁决不服，当事人可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向有管辖权的人民法院提起诉讼。未经仲裁程序，法院一般不予受理（除少数法定情形外）。

3. 审理程序与期限

   • 劳动仲裁：劳动仲裁程序相对简便、快捷。仲裁庭一般由一名仲裁员独任审理，案情复杂的可能由三名仲裁员组成合议庭。仲裁过程中更注重调解，从立案到作出裁决一般在45日内结束，案情复杂的可延长15日。
   • 申诉/诉讼：若进入诉讼程序，则遵循严格的民事诉讼程序，包括起诉、受理、审理前准备、开庭审理、判决等多个环节。一审普通程序的审限一般为六个月，特殊情况可延长；简易程序审限为三个月。

4. 举证责任与证据规则

   • 劳动仲裁：在劳动仲裁中，一般由用人单位承担主要的举证责任。证据规则相对灵活，仲裁员在证据审查和认定上有一定的自由裁量权。
   • 申诉/诉讼：在劳动争议诉讼中，双方当事人均需承担相应的举证责任。严格遵循民事诉讼的证据规则，对证据的合法性、真实性、关联性要求较高。

5. 裁决/判决效力

   • 劳动仲裁：仲裁裁决作出后，部分裁决（终局裁决）对用人单位而言具有终局效力，用人单位不能再向法院起诉；但劳动者对终局裁决不服仍可起诉。非终局裁决，双方均可在规定期限内向法院起诉。一旦起诉，仲裁裁决即不生效。
   • 申诉/诉讼：法院的判决书一经作出即具有法律效力。一审判决作出后，当事人在规定的上诉期内未上诉的，判决即发生法律效力；若一方上诉，则进入二审程序，二审判决为终审判决，具有最终的法律效力。

总结与建议：

• 劳动仲裁是劳动争议处理的前置程序，具有简便、快捷的特点，且不收费，适合处理简单、明确的劳动争议。
• 若对劳动仲裁裁决不服，或劳动争议较为复杂、争议较大，则可能需要通过劳动争议诉讼（即向法院提起诉讼）来寻求最终的解决方案。

在实际操作中，建议您根据具体情况选择合适的方式来维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。