结论：公司提前三天放假并扣除年休假是否违法，需根据具体情况判断，主要看公司此举是否符合法律法规及劳动合同、公司规章制度的规定。以下从不同角度进行分析：
法律法规层面：
- 根据《职工带薪年休假条例》的规定，职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，如果公司安排员工休年休假，应当按照正常工资标准支付工资，且不能随意扣除。
- 若公司提前放假并明确告知员工此假期为年休假，且按照正常工资标准支付了工资，同时这一安排不违反劳动合同或公司规章制度，那么公司的行为可能是合法的。
- 然而，如果公司未经员工同意，单方面将提前放假视为年休假，并扣除了相应的工资或福利，或者这一安排违反了劳动合同或公司规章制度，那么公司的行为就可能是违法的。
劳动合同与公司规章制度层面：
- 劳动合同是员工与公司之间约定权利和义务的法律文件。如果劳动合同中明确规定了年休假的安排、工资支付等事项，公司应当按照劳动合同的约定执行。
- 公司规章制度也是公司管理员工的重要依据。如果公司规章制度中规定了年休假的安排、工资支付等事项，且这些规定不违反法律法规，公司也应当按照规章制度执行。
- 因此，如果公司提前放假并扣除年休假的行为违反了劳动合同或公司规章制度的规定，那么这一行为就是违法的。
实际操作与沟通层面：
- 在实际操作中，公司应当与员工进行充分沟通，明确告知员工提前放假的性质、是否视为年休假、工资支付等事项。
- 如果员工对公司的安排有异议，公司应当听取员工的意见，并协商解决。如果公司未经沟通或协商，单方面做出决定，可能会引发劳动争议。
建议：
- 如果你认为公司的行为违法，可以先与公司进行沟通，了解公司的具体安排和依据，并表达自己的异议和诉求。
- 如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 在处理此类问题时，建议你保留好相关证据，如劳动合同、公司规章制度、工资条、放假通知等，以便在需要时提供证明。
可能后果：
- 如果公司的行为被认定为违法，公司可能需要支付你相应的工资差额、经济补偿等，并可能面临劳动监察部门的处罚。
- 如果因此引发劳动争议，你可能需要投入一定的时间和精力来处理，但这也是维护自己合法权益的必要途径。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。