在劳动争议案件中，员工自动离职的举证责任一般归用人单位承担。以下是对这一问题的详细分析：
举证责任分配原则
在劳动争议案件中，举证责任的分配通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。然而，在特定情况下，如涉及劳动关系解除等事实的认定，法律可能规定由用人单位承担举证责任。这是因为用人单位在劳动关系中通常处于管理地位，掌握着更多的证据资源，如员工考勤记录、工作交接单等。
员工自动离职的举证责任
用人单位主张员工自动离职：
- 当用人单位主张员工自动离职时，需要提供充分的证据来证明这一事实。这通常包括员工未按规定办理离职手续、未进行工作交接、连续旷工达到一定天数等证据。
- 如果用人单位无法提供这些证据，或者提供的证据不足以证明员工自动离职的事实，那么用人单位可能需要承担举证不能的不利后果，即被认定为违法解除劳动关系。
员工否认自动离职：
- 如果员工否认自动离职，并主张是被用人单位违法解除劳动关系，那么员工需要提供初步的证据来支持其主张，如用人单位发出的解除劳动合同通知书、同事的证言等。
- 然而，在大多数情况下，员工自动离职的事实主要由用人单位来证明，因为员工自动离职后，往往不再与用人单位保持联系，也难以提供直接证据来证明其离职方式。
法律后果与风险提示
- 用人单位举证不能：如果用人单位无法证明员工自动离职的事实，而员工又主张是被违法解除劳动关系，那么用人单位可能需要支付违法解除劳动关系的赔偿金。
- 员工举证不能：如果员工无法提供初步证据来支持其主张，且用人单位能够证明员工自动离职的事实，那么员工可能无法获得违法解除劳动关系的赔偿金，甚至可能因旷工等行为而承担相应的法律责任。
实际操作建议
- 用人单位：在员工离职时，应及时办理离职手续，要求员工填写离职申请表、进行工作交接等，并保留好相关证据。同时，建立健全的考勤管理制度，确保能够准确记录员工的出勤情况。
- 员工：如果因特殊原因需要自动离职，应提前与用人单位沟通，并尽量办理好离职手续，以避免不必要的法律纠纷。如果认为用人单位违法解除了劳动关系，应及时收集证据并寻求法律帮助。
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