针对您提出的“单位巡查失当该怎么处理”的问题，这确实是一个需要严肃对待并细致处理的情况。以下是我根据相关党规党纪和巡视巡察工作的要求，为您提供的详细解答：
首先，我们要明确的是，巡视巡察整改是严肃的政治任务，它直接反映了被巡视巡察党组织的政治态度和能力，是检验其对党忠诚不忠诚、“四个意识”强不强、践行“两个维护”坚决不坚决的重要标准。因此，如果单位在巡查过程中出现失当，或者巡查后整改落实不到位，这将会带来严重的后果。
一、失当行为的性质认定
主观故意与过失：
- 如果单位或相关责任人员主观上具有对抗巡视巡察整改制度的故意，比如故意隐瞒问题、提供虚假情况、拒绝提供必要资料等，那么这种行为将涉嫌违反政治纪律。
- 如果主观上是因过失，或者存在不可抗力、意外事件等因素导致整改不及时、不彻底，那么党组织会根据党员干部的主观心态、危害后果、问题原因等因素，综合判断其是否应当承担党纪责任，是否构成违反工作纪律或其他违纪行为。
行为表现：
- 干扰巡视巡察工作的行为，如隐瞒不报、提供虚假情况、拒绝提供文件资料、指使或强令干扰阻挠巡视工作等。
- 落实巡视巡察整改要求不到位的行为，如敷衍应付、虚假整改等。
二、处理措施
党纪处分：
- 根据《中国共产党纪律处分条例》的相关规定，对于干扰巡视巡察工作或者不落实巡视巡察整改要求的直接责任者和领导责任者，视情节轻重给予相应处分。情节较轻的，给予警告或者严重警告处分；情节较重的，给予撤销党内职务或者留党察看处分；情节严重的，给予开除党籍处分。
组织处理：
- 除了党纪处分外，党组织还可以根据具体情况，对相关责任人员进行组织处理，如调整岗位、免职、责令辞职等。
整改落实：
- 对于巡查中发现的问题，单位必须认真对待，制定切实可行的整改措施，并明确整改时限和责任人。同时，要加强整改过程的监督和检查，确保整改工作落到实处。
建立长效机制：
- 单位应以此次巡查为契机，深入分析问题产生的原因，查找制度漏洞和管理短板，建立健全长效机制，防止类似问题再次发生。
三、预防与应对
加强教育引导：
- 单位应加强对党员干部的教育引导，提高其对巡视巡察工作重要性的认识，增强配合巡视巡察工作的自觉性和主动性。
完善制度保障：
- 建立健全巡视巡察工作相关制度，明确工作流程和责任分工，确保巡视巡察工作有章可循、有据可查。
强化监督执纪：
- 加强对巡视巡察工作的监督执纪力度，对发现的问题及时进行处理和通报，形成有效的震慑作用。
综上所述，单位巡查失当是一个严重的问题，必须认真对待并妥善处理。通过党纪处分、组织处理、整改落实和建立长效机制等措施，我们可以有效纠正巡查失当行为，推动单位健康发展。同时，通过加强教育引导、完善制度保障和强化监督执纪等预防措施，我们可以进一步降低巡查失当的风险。