结论：将公证书提交给行政复议机关后，公证书是否退还取决于行政复议机关的具体处理情况及案件需要，无法一概而论。以下从不同角度进行分析：
行政复议机关的处理流程：
- 在行政复议过程中，行政复议机关会接收并审查申请人提交的证据材料，包括公证书。
- 如果公证书是案件的关键证据，且行政复议机关需要进一步审查或作为裁决的依据，那么公证书可能会被留存，不会退还。
- 如果公证书在审查过程中并非必需，或者行政复议机关已经完成了对公证书的审查并确认了其效力，那么在行政复议程序结束后，公证书有可能会被退还。
案件的具体情况：
- 每个行政复议案件的具体情况都不同，包括案件的复杂性、证据的充分性、争议点的多少等。
- 如果案件复杂，需要长时间审查，且公证书是重要证据，那么公证书被留存的可能性较大。
- 如果案件相对简单，且公证书并非核心证据，那么公证书被退还的可能性就相对较大。
行政复议机关的实践做法：
- 不同的行政复议机关在处理案件时可能有不同的实践做法。
- 有些行政复议机关可能会明确告知申请人公证书是否会被退还，以及退还的时间和方式。
- 有些行政复议机关则可能不会明确告知，而是根据案件处理情况来决定。
建议：
- 如果您担心公证书的退还问题，可以在提交公证书时向行政复议机关咨询相关流程和规定。
- 您也可以要求行政复议机关在接收公证书时出具接收凭证，并注明公证书的名称、数量及提交时间等信息，以便在需要时进行查询和追踪。
- 如果行政复议程序结束后，您未收到公证书的退还，且担心公证书的丢失或损坏，您可以向行政复议机关咨询公证书的去向，并要求其给出合理的解释和处理方案。
法律背景：
- 行政复议是公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益时，依法向行政复议机关提出复查该具体行政行为的申请，行政复议机关依照法定程序对被申请的具体行政行为进行合法性、适当性审查，并作出行政复议决定的一种法律制度。
- 在行政复议过程中，申请人需要提交相关证据材料以支持其复议申请。公证书作为一种具有法律效力的证据材料，经常被用于行政复议案件中。然而，关于公证书的退还问题，法律并未作出明确规定，而是由行政复议机关根据案件具体情况和实际需要来决定。