结论：境外代孕回国的孩子，即使最后通过法院判决确认亲子关系，其落户问题仍可能面临复杂情况，能否落户需结合具体法律法规及当地户籍政策综合判断。以下从法律背景、亲子关系确认、落户可能性及建议等角度进行详细分析。
一、法律背景
代孕行为的法律性质：
- 在我国，代孕行为通常被视为违法，因为代孕涉及对女性身体权益的侵犯，以及可能引发的伦理、道德和社会问题。因此，代孕合同在我国一般被认定为无效合同。
亲子关系的确认：
- 亲子关系的确认通常基于生物学关系或法律关系。在代孕情况下，由于代孕母亲并非生物学上的母亲（除非使用代孕母亲自己的卵子），因此亲子关系的确认可能涉及复杂的法律程序。
- 法院判决确认亲子关系，通常需要基于充分的证据，如DNA鉴定结果等，以证明孩子与请求确认亲子关系的一方之间存在生物学上的联系。
二、亲子关系确认后的落户问题
落户的基本条件：
- 落户通常需要满足一定的条件，如提供出生证明、父母身份证明、结婚证等文件。在代孕情况下，由于代孕行为的违法性，可能无法直接获得合法的出生证明。
- 即使通过法院判决确认了亲子关系，落户时仍可能面临户籍管理部门的严格审查，因为代孕行为本身不受法律保护。
落户的可能性：
- 如果代孕行为发生在国外，且孩子已在国外出生并获得出生证明：在这种情况下，即使通过法院判决确认了亲子关系，落户时仍需考虑国内户籍政策对代孕行为的立场。一些地区可能对代孕行为持严格禁止态度，因此落户可能面临困难。
- 如果代孕行为未涉及国外，但孩子通过非法手段获得出生证明：这种情况下，落户几乎不可能，因为出生证明本身是违法的，无法作为合法落户的依据。
- 如果通过法院判决确认了亲子关系，且该判决被户籍管理部门认可：在某些情况下，如果法院判决具有足够的法律效力，且户籍管理部门愿意根据判决办理落户手续，那么孩子可能有机会落户。但这通常取决于具体地区的户籍政策和法院判决的具体内容。
三、建议
咨询当地户籍管理部门：
- 在尝试落户前，建议先咨询当地户籍管理部门，了解他们对代孕行为及通过法院判决确认亲子关系后落户的具体政策和态度。
准备充分证据：
- 如果决定尝试落户，应准备充分的证据，包括法院判决、DNA鉴定结果、出生证明（如果可能获得）等，以证明孩子与父母之间的亲子关系。
考虑其他法律途径：
- 如果落户面临困难，可以考虑通过其他法律途径解决孩子的身份问题，如收养程序等。但需注意，收养程序也有其严格的法律要求和程序。
寻求专业法律帮助：
- 由于代孕和落户问题涉及复杂的法律和政策，建议寻求专业律师的帮助，以确保你的权益得到充分保护。
最后，境外代孕回国的孩子落户问题是一个复杂且敏感的问题，需要综合考虑法律、政策、伦理等多个方面。如果你面临这样的问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。