关于您提出的“实习单位只有合同专用章可以盖在实习证明上吗”这一问题，这主要取决于实习单位的具体规定以及学校或相关机构对实习证明的具体要求。
首先，我们需要明确的是，合同专用章和公章在法律上具有不同的效力和用途。公章是单位对外行使权力的标志，具有最高的法律效力，通常用于重要文件、合同、证明等。而合同专用章则主要用于签订合同，表明单位对合同内容的认可和承诺。
针对实习证明这一特定文件，其目的主要是为了证明您在实习单位的工作经历和表现。因此，从证明文件的有效性和权威性角度来看，使用公章通常更为合适，因为它代表了实习单位的正式认可和权威性。
然而，如果实习单位确实只有合同专用章，并且没有公章，或者由于某些特殊原因无法使用公章，那么是否可以使用合同专用章则需要根据具体情况来判断。在这种情况下，我建议您采取以下步骤：
咨询实习单位：首先，您可以向实习单位的人事部门或相关负责人咨询，了解他们对于实习证明盖章的具体规定和要求。他们可能会告诉您是否可以使用合同专用章，或者是否有其他替代方案。
了解学校或机构要求：其次，您需要了解学校或相关机构对实习证明的具体要求。如果学校或机构明确要求必须使用公章，那么您可能需要与实习单位协商，看是否能够找到其他解决方案，如使用实习单位的其他官方印章或获得实习单位出具的书面说明等。
考虑替代方案：如果实习单位确实无法提供公章，并且学校或机构也不同意使用合同专用章，那么您可以考虑与实习单位协商，看是否能够获得其他形式的证明，如实习单位出具的书面评价、工作记录等，以作为您实习经历的补充证明。
综上所述，虽然合同专用章和公章在法律上具有不同的效力和用途，但在特定情况下，如果实习单位确实只有合同专用章，并且学校或机构也同意接受，那么合同专用章也可以作为实习证明的盖章。然而，为了确保实习证明的有效性和权威性，我建议您尽可能使用公章，并在无法使用公章的情况下，与实习单位和学校或机构进行充分沟通，以找到最合适的解决方案。