结论：律师代理原告，同时在另一案件中代理被告起诉原原告，这种情况确实存在利益冲突，且通常是不被允许的。
分析如下：
法律法规的明确规定：
- 根据《中华人民共和国律师法》第三十九条，律师不得在同一案件中为双方当事人担任代理人，也不得代理与本人或者其近亲属有利益冲突的法律事务。这一规定直接禁止了律师在同一或相关案件中同时代理对立双方的情形，以维护法律的公正性和当事人的合法权益。
利益冲突的本质：
- 在诉讼中，原告和被告的利益诉求通常是相互对立的。如果律师同时代理双方，将无法全力维护双方的合法权益，因为任何一方的利益增加都可能意味着另一方的利益减少。这种利益冲突将使得律师陷入两难的境地，无法有效履行代理职责，甚至可能损害其中一方或双方当事人的利益。
职业道德与执业纪律的要求：
- 律师行业有着严格的职业道德和执业纪律规范，要求律师保持中立和公正，确保为每一位当事人提供独立、无偏见的法律服务。违反这一规定，律师将面临行业纪律处分，包括警告、罚款、暂停执业甚至吊销执业证书等处罚。
实际操作的复杂性：
- 即使两个案件在表面上看起来是独立的，但如果它们之间存在某种关联或影响，律师同时代理也可能引发利益冲突。例如，如果两个案件涉及相同的事实或法律问题，或者一个案件的结果可能影响另一个案件的结果，那么律师同时代理就可能构成利益冲突。
可能的例外情况与限制：
- 尽管存在上述一般原则，但在某些特殊情况下，如某地区只有一家律师事务所，且双方当事人均同意由该律所代理，并经过相关监管机构的批准和监督，理论上可能存在例外情况。然而，这种情况极为罕见，且必须严格遵循相关法律法规和职业道德规范，确保不会损害任何一方的合法权益。
建议：
- 如果您作为原告发现您的律师同时在另一案件中代理被告起诉您，您有权向该律师提出质疑，并要求其解释是否存在利益冲突。
- 如果律师无法给出合理的解释或您认为其解释不足以消除您的疑虑，您可以考虑更换律师或向相关监管机构投诉。
- 在选择律师时，建议您仔细了解其执业经历和信誉，确保选择一位能够独立、公正地代表您利益的律师。
最后，如果您有任何关于合同纠纷或其他法律问题的疑问，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。