结论：在摩托车交通事故中，若您承担次要责任且交强险的18000元医疗费用赔偿限额已用完，剩余的医疗费用及其他相关损失，您是否需要自己承担，取决于多个因素，包括事故责任比例、是否购买了商业保险以及对方是否购买了相应保险等。
详细分析：
交强险赔偿限额：
- 交强险（机动车交通事故责任强制保险）的医疗费用赔偿限额通常为18000元。这一限额是针对每次事故中所有受害人的医疗费用总和。
- 若该限额已用完，交强险将不再对医疗费用进行赔偿。
事故责任比例：
- 在交通事故中，责任比例是决定各方承担赔偿金额的关键因素。若您承担次要责任，那么您将承担事故总损失的一部分，具体比例根据事故具体情况和交警认定书确定。
- 例如，如果事故总损失为10万元，您承担30%的责任，那么您理论上需要承担3万元的赔偿。
商业保险：
- 如果您购买了商业第三者责任险（简称“商业险”），那么超出交强险赔偿限额的部分，可以由商业险在保险金额内进行赔偿。
- 商业险的赔偿金额和范围取决于您购买的保险条款和保额。
对方保险情况：
- 如果对方也购买了保险，特别是交强险和商业险，那么对方的保险公司也可能需要承担部分赔偿责任。
- 这取决于事故责任比例和对方的保险条款。
自费部分：
- 若交强险和商业险的赔偿金额均不足以覆盖您的赔偿责任，或者您未购买商业险，那么剩余的赔偿金额将需要由您自行承担。
- 这包括医疗费用、误工费、护理费、营养费、残疾赔偿金（如适用）等。
具体计算示例（假设情况）：
- 假设事故总损失为10万元，其中医疗费用为6万元。
- 您承担30%的责任，即3万元。
- 交强险医疗费用赔偿限额已用完，因此交强险不再赔偿医疗费用。
- 若您购买了保额为5万元的商业险，且商业险条款覆盖医疗费用，则商业险将赔偿您应承担的3万元中的部分或全部（具体取决于商业险条款和是否有免赔额等）。
- 若商业险赔偿后仍有不足，或您未购买商业险，则剩余部分将需要由您自行承担。
建议：
- 在处理此类事故时，建议首先与对方及各自的保险公司进行沟通，明确各自的责任和赔偿范围。
- 若对赔偿金额或责任比例有争议，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
- 在未来，考虑购买足够的商业保险以增加自己的保障，减少因交通事故可能带来的经济负担。
如有任何进一步的问题或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。