当摩托车在交通事故中承担次要责任，并且涉及到交强险的赔偿问题时，具体的赔偿流程和规则如下：

交强险的赔偿责任限额：

• 摩托车为次要责任时，若造成对方人身伤亡，交强险的医疗费用赔偿限额为18000元，死亡伤残赔偿限额为180000元，财产损失赔偿限额为2000元。

赔偿原则：

• 交强险会首先在责任限额内进行赔偿。
• 若实际损失超过交强险的赔偿限额，超出部分将由事故双方按照各自的责任比例进行分担。

责任比例划分：

• 若摩托车与行人或非机动车发生事故，且摩托车为次要责任，通常摩托车方将承担40%的赔偿责任（行人或非机动车为主要责任方，承担60%），但这一比例可能因具体情况和法院判断而有所调整。
• 若双方均为机动车，且摩托车为次要责任，则摩托车方通常承担30%的赔偿责任，主要责任方承担70%。

赔偿流程：

1. 事故发生后：首先确保受伤人员得到及时救治，并报警处理。
2. 责任认定：交警部门会进行事故责任认定，明确各方责任比例。
3. 交强险赔偿：根据事故责任认定，交强险会在责任限额内对受损方进行赔偿。
4. 超出部分分担：若实际损失超过交强险赔偿限额，超出部分由事故双方按照责任比例进行分担。
5. 协商或诉讼：对于赔偿金额和分担比例，双方可先进行协商。若协商不成，可通过法律途径解决。

注意事项：

• 在处理赔偿事宜时，请务必保留好相关证据和文件，如医疗费用发票、事故责任认定书等。
• 若涉及法律诉讼，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。

综上所述，当摩托车在交通事故中承担次要责任时，交强险会首先在责任限额内进行赔偿。若实际损失超过交强险赔偿限额，超出部分将由事故双方按照各自的责任比例进行分担。在处理赔偿事宜时，请务必遵循相关法律法规和程序，确保赔偿工作的顺利进行。