当在一个案件中起诉两个不同的被告时，法院的处理和判决会遵循一系列严谨的原则和程序。以下是对这一问题的详细解答：
一、法院的判决原则
独立审判原则：
- 法院会对每个被告的行为和责任进行独立的审查和判断。这意味着，一个被告的行为或责任不会自动影响到另一个被告的判决。法院会分别评估每个被告在案件中的角色和责任。
证据裁判原则：
- 判决是基于事实和法律的，特别是原告提供的证据以及被告的抗辩理由。法院会仔细审查双方提交的所有证据，包括书面证据、证人证言、专家意见等，以确定每个被告的责任。
适用法律原则：
- 法院会根据案件的性质和涉及的法律条款来依法作出判决。这要求法院对相关法律有深入的理解，并能够准确地将法律应用于案件事实。
二、可能的判决结果
各自承担责任：
- 如果两个被告的行为是独立的，且各自对损害结果负有不同程度的责任，法院可能会分别判定他们承担各自相应的责任。例如，在侵权案件中，如果两个被告分别实施了不同的侵权行为，导致原告受损，法院可能会根据各自的过错程度，判决他们承担按份责任或连带责任。
共同承担责任：
- 如果两个被告的行为构成共同侵权或共同犯罪，法院可能会判决他们共同承担责任。在这种情况下，原告可以向任何一个被告要求全部赔偿，而被告之间则可能需要根据内部约定或法院判决来确定各自应承担的份额。
部分被告承担责任：
- 如果经过审理，法院认为其中一个被告的行为与损害结果无因果关系，或者该被告有充分的抗辩理由（如正当防卫、紧急避险等），那么该被告可能会被免除责任。另一个被告则需要根据其行为对损害结果的贡献程度来承担相应的责任。
驳回原告诉讼请求：
- 如果原告未能提供足够的证据证明两个被告的行为构成侵权或犯罪，或者原告的诉讼请求缺乏法律依据，法院可能会判决驳回原告的诉讼请求。这意味着原告需要承担举证不能的法律后果。
三、实际操作建议
- 充分准备证据：作为原告，你需要准备充分的证据来证明两个被告的行为与损害结果之间的因果关系，以及各自的责任程度。
- 明确诉讼请求：在起诉时，你需要明确你的诉讼请求，包括要求两个被告承担何种责任（如赔偿损失、赔礼道歉等）。
- 了解法律程序：你需要了解相关的法律程序，包括起诉、答辩、举证、质证、辩论等环节，以便在诉讼过程中能够充分维护自己的权益。
总之，当在一个案件中起诉两个不同的被告时，法院会根据案件的具体事实、证据以及适用的法律规定来综合判定。作为原告，你需要充分准备证据、明确诉讼请求，并了解相关的法律程序，以便在诉讼过程中能够充分维护自己的权益。