关于农村申请宅基地是否收取办理费的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要结合具体情况和相关法律法规来综合判断。
首先，明确基本原则：
根据《关于进一步加强农村宅基地管理的通知》及《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农村村民申请宅基地是依法享有的一项权利，且农村宅基地属于农民集体所有。在符合相关规划和条件的情况下，申请宅基地本身是不收取费用的，这是为了确保农民能够公平、合理地获得宅基地用于住房建设，避免因经济因素影响农民的基本居住权利。
接下来，分析可能涉及的费用情况：
土地证书工本费：
- 农民经批准使用宅基地后，需要支付土地证书工本费，这是宅基地申请过程中最基本的费用，标准通常为5元/户。
测量费：
- 在申请宅基地时，为了准确测量宅基地的面积和边界，可能需要由专业的测绘机构进行测量，并收取一定的测量费。这个费用通常根据宅基地的面积大小来计算，具体标准因地区而异。
证件办理费用：
- 负责宅基地审批和证件办理的相关政府部门可能会收取一定的证件办理费用，用于证件的制作、登记等管理成本。这个费用相对较低，一般在几十元左右。
特殊情况下的费用：
- 如果申请的宅基地是耕地，按照《土地管理法》的规定，可能需要补充占用面积相当的耕地以实现占补平衡，此过程可能产生耕地开垦费。
- 如果申请的宅基地面积超过当地规定标准或旧宅基地原址改建住宅超过原面积，可能也需要支付额外费用，用于耕地开垦或占补平衡。
- 部分地区可能还存在基础设施配套费，由当地政府或相关部门收取，用于宅基地所在区域的基础设施建设和改善。
再来看合法性的判断标准：
- 是否有明确的法律法规依据：任何收费都必须有明确的法律法规或政策依据，否则即为不合法。
- 是否经过合法的审批程序：即使存在合法收费的情况，也必须经过合法的审批程序，如召开村民会议或村民代表会议进行民主讨论和表决，并将收费标准、用途等事项进行公示。
- 是否做到公开透明、公平公正：收费标准必须公开透明，不能存在暗箱操作或歧视性收费。
最后，给出建议：
- 村民在遇到宅基地收费问题时，首先应查阅当地的相关法规和政策，了解收费的依据和标准。
- 关注收费程序是否合法、透明，是否有经过民主讨论和表决，并进行了公示。
- 如有疑虑或不满，可及时向相关部门咨询或投诉举报，以维护自己的合法权益。
综上所述，农村申请宅基地在大多数情况下是不收取办理费的，但在特定情况下如测量、证件办理、特殊土地类型或超面积申请时，可能会涉及一些额外费用。具体费用标准需根据当地政策和实际情况确定，并确保收费的合法性和合理性。