分公司注销后，申请工伤的主体问题，主要取决于分公司的法律地位以及注销后的责任承担情况。以下从不同角度进行分析：
分公司具有独立法律地位且未完全注销时：
- 如果分公司虽然处于注销过程中，但尚未完成全部注销手续，且在法律上仍被视为一个独立的经营实体，那么在此期间发生的工伤事故，申请工伤的主体仍然是该分公司。不过，由于分公司即将注销，实际操作中可能会面临一些困难，如分公司可能已无人员处理相关事务，此时可考虑由总公司代为处理。
分公司已完全注销，但总公司存在时：
- 分公司作为总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，如果分公司已经完成注销手续，那么在此之后发现的工伤事故（若事故发生在注销前），申请工伤的主体应为总公司。总公司需要承担起原本应由分公司承担的工伤赔偿责任。
- 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第十四条：“公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。”这一条款明确了分公司在法律上的地位以及责任承担方式。
分公司与总公司均已注销或不存在时：
- 在极端情况下，如果分公司和总公司均已注销或不存在，那么申请工伤的主体将不复存在。此时，工伤职工或其家属可能面临无法获得工伤赔偿的困境。不过，这种情况在实际中较为罕见，因为通常总公司不会轻易注销，尤其是在分公司存在未了结的工伤事故时。
法律建议：
- 对于工伤职工或其家属而言，在分公司注销后申请工伤时，应首先确认分公司的注销状态以及总公司的存在情况。
- 如果分公司尚未完全注销，应尽快向分公司提出工伤申请，并同时关注总公司的动态，以防分公司注销后无人负责。
- 如果分公司已经注销，应直接向总公司提出工伤申请，并要求总公司承担相应的赔偿责任。
- 在整个过程中，建议工伤职工或其家属咨询专业律师，以确保自己的权益得到充分保障。
可能面临的法律后果：
- 如果工伤职工或其家属未能及时、正确地选择申请工伤的主体，可能会导致工伤赔偿的延误或无法获得赔偿。
- 总公司如果拒绝承担分公司的工伤赔偿责任，可能会面临法律诉讼和相应的法律责任。
总结：分公司注销后申请工伤的主体主要取决于分公司的法律地位以及注销后的责任承担情况。在大多数情况下，如果分公司已注销但总公司存在，申请工伤的主体应为总公司。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。