结论：在执行债务已经还清但原告不撤诉的情况下，您可以通过一系列法律程序来维护自己的合法权益，确保案件得到公正处理。
一、确认还款事实并保留证据
- 收集还款凭证：首先，您需要确保已经保留了所有与还款相关的凭证，如银行转账记录、收据、聊天记录（需能明确显示还款金额和双方身份）等。这些证据是证明您已经履行还款义务的关键。
- 核对借款合同：检查借款合同或借条上的还款条款，确认您是否按照约定的方式和时间进行了还款。这有助于您在后续的法律程序中更有力地证明自己的还款行为。
二、与原告沟通协商
- 主动联系原告：在确认还款事实后，主动与原告联系，明确告知其债务已经清偿，并请求其及时向法院提交撤诉申请。通过沟通，您可以了解原告不撤诉的原因，并尝试寻求解决方案。
- 保留沟通记录：在与原告沟通过程中，保留相关记录，如聊天记录、通话录音等。这些记录可能在后续的法律程序中作为证据使用。
三、向法院提供证据并申请处理
- 准备并提交材料：收集并整理好能证明债务已清偿的证据材料，包括银行转账记录、收条、还款协议等。将这些材料通过正规的送达方式，如法院专递邮寄或直接到法院立案窗口提交给法院，并向法官说明债务已经履行完毕的情况，申请法院审查并考虑终结诉讼程序。
- 申请法院核实：如果原告拒绝沟通或沟通无果，您可以向法院提出申请，请求法院依职权对债务履行情况进行调查核实。法院有权通过多种方式核实，如查询相关银行等金融机构的资金流转情况等。一旦法院查明债务确实已经全部履行，会依法作出裁定终结执行程序，并解除对您采取的各项执行措施。
- 申请结案通知书：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，债务已经清偿的，人民法院应当裁定终结执行。因此，您还可以向法院申请出具结案通知书，以证明案件已经了结。
四、关注法律后果及后续事项
- 避免重复起诉风险：若原告隐瞒还款事实继续起诉，可能导致您面临重复应诉的困扰。通过及时提交还款证明，您可以有效防止此类情况发生。
- 信用记录修复：即使案件未正式撤诉，只要您能提供充分证据证明债务已清偿，相关不良信用记录可通过合法途径申请消除。建议您定期查询个人征信报告，发现异常及时维权。
五、考虑其他法律途径
- 向上级法院申诉：如果执行法院在合理期限内未对您的已履行情况进行正确处理，导致您权益受损，您可以向上一级法院提出申诉，反映情况，请求上级法院监督执行法院依法终结执行程序。
- 提起诉讼要求赔偿：如果因为原告的恶意拖延或者不撤销执行给您造成了额外的损失，您还可以考虑向法院提起诉讼，要求原告承担相应的赔偿责任。
六、保持冷静与理性应对
面对原告不撤诉的情况，请保持冷静和理性，采取合适的措施来解决问题。尊重法律程序和法院的裁决，不要采取过激行为或非法手段来应对。
后续建议：在整个过程中，如果您对法律程序或自身权益保护存在疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。