针对您提出的“单位之间债务过了两年还能起诉吗怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，关于诉讼时效期间，根据我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，从债务履行期限届满之日起的三年内，您作为债权人有权通过向法院起诉的方式来主张自己的债权。因此，即使债务已经过了两年，只要仍在三年诉讼时效期间内，您仍然可以起诉。

其次，如果债务已经超过了三年的诉讼时效期间，您仍然可以向法院提起诉讼。但需要注意的是，在诉讼过程中，如果债务人以诉讼时效期间届满为由进行抗辩，并且经法院查明没有诉讼时效中止、中断或延长等法定事由，那么您的胜诉权可能会受到影响，即法院可能不会支持您要求债务人履行债务的诉求。

然而，这里有一个重要的点需要注意，那就是诉讼时效的中断与重新计算。如果在超过两年甚至可能接近或超过三年的期间内，存在一些导致诉讼时效中断的情形，如您向债务人主张过权利（书面催款、口头催款、发送短信或打电话催债等）、债务人同意履行义务、或者之前已经提起过诉讼但未能得到解决等，那么诉讼时效就会重新计算。这些行为都能够有效地中断诉讼时效的进行，从而为您争取更多的时间来维护自己的权益。

最后，鉴于债务问题的复杂性和诉讼时效等法律规定的专业性，我建议您在处理此类问题时，及时寻求专业律师的帮助。专业律师能够根据您的具体情况，提供针对性的法律分析和建议，帮助您更好地了解自己的权益和义务，以及如何有效地通过法律途径来维护自己的合法权益。

综上所述，即使单位之间的债务已经过了两年，您仍然有可能通过起诉来维护自己的权益，但关键在于是否存在诉讼时效中断的情形以及能否有效应对债务人的抗辩。因此，在处理此类问题时，请务必谨慎行事，并考虑寻求专业律师的法律援助。