双方签订的车库买卖协议，在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下，是具有法律效力的。以下是对这一结论的详细分析：
一、合同有效的基本条件
主体适格：
- 签订车库买卖协议的双方当事人必须具备相应的民事行为能力，即双方均为完全民事行为能力人，能够独立实施民事法律行为。若一方为限制民事行为能力人或无民事行为能力人，则合同效力可能存在瑕疵或无效。
意思表示真实：
- 合同的签订必须是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫、乘人之危、显失公平、重大误解等情形。例如，如果卖方故意隐瞒车库存在质量问题或产权纠纷等重要信息，导致买方在不知情的情况下签订合同，买方有权主张合同无效或请求撤销。
内容合法合规：
- 合同内容和形式不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。车库不能是非法占用公共土地或属于人防工程等不得转让的类型，否则合同将因内容违法而无效。
形式合法：
- 车库买卖合同通常采用书面形式，并由双方签字（或盖章）确认。书面合同并签字确认是普遍且推荐的做法，以确保合同的明确性和可执行性。
二、合同的具体条款与效力
车库买卖协议应明确约定车库的基本情况（如位置、大小、产权状况等）、价格、付款方式、交付时间、违约责任及争议解决方式等重要条款。这些条款的清晰约定有助于避免后续纠纷，并确保合同的全面履行。如果合同条款存在模糊或不明确之处，可能导致双方对合同的理解产生分歧，进而引发纠纷。
三、物权登记与合同效力的关系
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，未办理物权登记的，并不影响合同的效力。即使车库尚未办理物权登记，只要买卖协议符合上述有效条件，该协议仍然具有法律效力。然而，为了保障买方的权益，建议在协议签订后尽快办理物权登记手续，以确保买方能够取得车库的所有权。
四、特殊情况下的法律效力分析
无权处分：
- 如果卖方对车库没有处分权（如车库是共有财产但未经其他共有人同意），则协议效力待定。若其他共有人事后追认，则协议有效；若不追认，则协议无效。
产权不清晰：
- 如果车库没有产权证或产权不清晰，那么买卖协议可能无法受到法律保护。买方在购买前应仔细核实车库的产权状况，以避免潜在的法律风险。例如，可以通过查询不动产登记簿或咨询相关部门来确认车库的产权情况。
恶意串通：
- 若买卖双方恶意串通，损害了第三人的合法权益（如为逃避债务而虚假买卖车库），则该协议无效。此行为不仅损害了他人的利益，也破坏了市场的公平交易秩序。
五、法律建议
在签订协议前：
- 双方应仔细核实车库的产权状况，确保卖方具有合法的处分权。
- 双方应就车库的基本情况、价格、付款方式等重要条款进行充分协商，并明确约定在协议中。
在签订协议时：
- 双方应确保意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 协议应采用书面形式，并由双方签字（或盖章）确认。
在签订协议后：
- 双方应尽快办理物权登记手续，以确保买方能够取得车库的所有权。
- 如果发生纠纷，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。
综上所述，双方签订的车库买卖协议在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下是具有法律效力的。为了确保协议的合法性和有效性，建议在签订前仔细核实车库的产权状况及协议条款，并在签订后尽快办理物权登记手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。