结论：因休病假单位扣发年终奖，您确实可以到劳动部门申请仲裁，但是否能要求单位给予经济补偿，需根据具体情况来判断。

分析如下：

1. 年终奖的性质与发放条件：

   • 年终奖通常被视为用人单位对员工一年工作表现的奖励，其发放与否及发放标准往往与公司的规章制度、劳动合同或集体合同中的约定有关。
   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了年终奖的发放条件，且这些条件不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合这些条件的情况下发放年终奖是合法的。

2. 病假与年终奖的关系：

   • 病假是员工因疾病或非因工负伤需要暂停工作接受治疗时，依法享受的带薪休假。
   • 如果公司规章制度或劳动合同中明确规定，病假期间不享受年终奖或年终奖按一定比例扣发，且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位扣发年终奖可能是合法的。
   • 然而，如果公司规章制度或劳动合同中没有这样的规定，或者规定本身违反了法律法规的强制性规定（如歧视性条款），那么用人单位扣发年终奖就可能是违法的。

3. 申请仲裁与经济补偿：

   • 如果您认为用人单位扣发年终奖的行为违法，您可以向劳动部门申请仲裁，要求用人单位支付被扣发的年终奖。
   • 关于经济补偿，这通常取决于仲裁结果。如果仲裁认定用人单位扣发年终奖的行为违法，那么除了要求用人单位支付被扣发的年终奖外，您还可能根据《劳动合同法》的相关规定，要求用人单位支付经济补偿（如违法解除劳动合同的赔偿金，但在此情况下更可能是要求支付拖欠的工资报酬的加付赔偿金，具体需根据实际情况判断）。不过，直接要求经济补偿可能并不总是适用，因为经济补偿通常与劳动合同的解除或终止相关，而年终奖的扣发并不直接等同于劳动合同的解除或终止。但如果您因用人单位的违法行为（如违法扣发年终奖）而被迫解除劳动合同，那么您可能有权要求经济补偿。

4. 建议与行动：

   • 首先，仔细审查您的劳动合同和公司规章制度，了解年终奖的发放条件和病假期间的相关规定。
   • 如果认为用人单位扣发年终奖的行为违法，收集相关证据（如劳动合同、公司规章制度、病假证明、年终奖发放记录等）。
   • 向当地劳动部门申请仲裁，提交您的证据和仲裁申请书。
   • 在仲裁过程中，积极配合仲裁机构的调查和调解工作，争取您的合法权益。

后续思考：

• 在处理此类纠纷时，了解并熟悉相关法律法规和公司规章制度至关重要。
• 如果对仲裁结果不满意，您还可以考虑向人民法院提起诉讼，以进一步维护您的合法权益。
• 在未来的工作中，建议定期与用人单位沟通，了解您的权益和义务，避免类似纠纷的发生。

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