核心结论：针对拖车费实付1200元但发票金额1300元、对方不认可的情况，可通过以下步骤解决：

1. 核查合同或协议条款
   首先检查双方签订的拖车服务合同、报价单或口头协议中是否明确约定了费用标准。若合同中写明费用为1200元，但对方开具1300元发票，可能存在以下两种情况：

   • 对方多开发票：若对方无合理理由（如额外服务未告知），可能涉及虚开发票或违约，可要求对方重新开具与实际支付金额一致的发票，并保留书面沟通记录（如微信、邮件）。
     
   • 己方理解偏差：若合同中存在模糊条款（如“含税价”“附加费”），需结合行业惯例判断1300元是否合理。例如，若1200元为不含税价，1300元可能包含税费，此时需确认税费承担方是否在合同中约定。

2. 固定证据链
   无论对方是否认可，需立即收集以下证据以证明实际支付金额为1200元：

   • 支付凭证：银行转账记录、微信/支付宝转账截图（需显示对方账户信息及金额）；
     
   • 沟通记录：与对方协商费用的聊天记录、录音（需明确提及“实付1200元”）；
     
   • 服务确认单：若拖车完成后对方曾签字确认服务内容及费用（如1200元），可作为直接证据。
     若证据不足，可能面临举证困难，需尽快补充收集。

3. 协商或投诉解决

   • 协商：向对方书面说明情况（如发送律师函或正式函件），要求其：
     
     • 退还多收的100元；
       
     • 重新开具1200元发票；
       
     • 若对方拒绝，可提出通过第三方调解（如消费者协会、行业调解组织）解决。
       
   • 投诉：若对方为正规企业，可向当地税务部门举报其虚开发票行为（需提供发票复印件及支付凭证），税务部门介入后可能促使对方整改。

4. 法律途径
   若协商、投诉无果，可向法院起诉，主张：

   • 不当得利返还：要求对方退还多收的100元；
     
   • 违约责任：若合同明确约定费用为1200元，对方行为构成违约，可要求赔偿损失（如因发票问题导致的税务风险）；
     
   • 诉讼材料：需准备起诉状、证据清单、双方身份信息等，建议委托律师代理以提高效率。

风险提示：若对方坚持1300元为合理费用，需警惕其可能以“服务升级”“附加费”等理由抗辩。此时需结合证据判断对方主张是否成立，若无法证明，对方可能承担败诉风险。

建议行动顺序：先协商→固定证据→投诉→诉讼（最后手段）。若需进一步分析证据或起草法律文书，可直接向我咨询具体操作。