结论：在承包合同中，若仅约定“乙方所有费用自理，乙方所有收入自留”，而未明确提及房租或承包费的具体支付情况，房租的支付责任需根据合同的具体内容、双方的实际履行情况以及相关法律规定来综合判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合同解释原则：

   • 根据《民法典》的相关规定，合同解释应当遵循文义解释、整体解释、目的解释等原则。在合同条款存在歧义或不明确时，应结合合同的整体内容、双方交易习惯以及合同目的来综合判断。
   • 在本案例中，虽然合同未直接提及房租或承包费的支付，但“乙方所有费用自理”可能暗示乙方需承担包括房租在内的所有运营成本。然而，这一解释并非绝对，需结合其他条款和实际情况。

2. 双方实际履行情况：

   • 合同的履行情况是判断双方权利义务的重要依据。如果在实际履行过程中，乙方一直承担房租支付义务，且甲方未提出异议，那么可以认为双方已通过实际行为对合同进行了补充和明确。
   • 反之，如果双方对房租支付存在争议，且没有明确的书面证据表明乙方应承担房租，那么这一争议可能需要通过法律途径解决。

3. 相关法律规定：

   • 根据《民法典》第五百一十条：“合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。”
   • 在本案例中，如果双方无法就房租支付达成补充协议，且合同中没有其他相关条款或交易习惯可供参考，那么可能需要依据公平原则、诚实信用原则等法律原则进行判断。

4. 可能的法律后果：

   • 如果法院或仲裁机构认定乙方应承担房租支付义务，而乙方未履行，那么甲方有权要求乙方支付房租及可能的违约金或损失赔偿。
   • 如果法院或仲裁机构认定乙方无需承担房租支付义务，那么甲方可能需自行承担房租费用，或寻求其他法律途径解决争议。

建议：

• 双方协商：首先，建议双方尝试通过友好协商解决争议，明确房租的支付责任和方式。
• 补充协议：如果协商成功，双方可以签订补充协议，明确房租的支付条款，以避免未来再次发生争议。
• 法律途径：如果协商无果，双方可以考虑通过法律途径解决争议，如向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。

进一步思考：

• 在签订合同时，双方应尽可能明确所有条款，包括房租、承包费等关键费用的支付责任和方式，以避免未来发生争议。
• 如果合同中存在模糊或不明确的地方，双方应及时沟通并签订补充协议进行明确。

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