结论前置：劳动者在休带薪年休假期间，用人单位扣除其全勤奖一般是不合法的，但具体还需结合用人单位的规章制度或劳动合同中的相关规定来判断。

法律分析

1. 年休假与全勤奖的法律性质

   • 年休假：根据《职工带薪年休假条例》，连续工作1年以上的职工享受带薪年休假，这是劳动者的法定权利。在年休假期间，职工应享受与正常工作期间相同的工资收入，包括基本工资、奖金、津贴等。
   • 全勤奖：全勤奖是用人单位为激励员工全勤上班而设置的奖励机制，属于内部管理和薪酬分配范畴。其发放条件和标准通常由用人单位通过规章制度或劳动合同明确。

2. 扣全勤奖的合法性判断

   • 不合法情形：

     • 若用人单位的规章制度或劳动合同中未明确规定休年休假会影响全勤奖的发放，则员工休年休假是合法行使权利，用人单位不得以此为由扣除全勤奖。因为年休假是带薪休假，员工在休假期间的工资待遇（包括全勤奖）不应受影响。
     • 根据《企业职工带薪年休假实施办法》，用人单位未安排或未完全安排年休假的，需支付额外的工资报酬，这进一步强调了年休假期间员工应享有的工资权益。

   • 可能合法的情形（但需谨慎）：

     • 若用人单位的规章制度或劳动合同中明确规定了全勤奖的定义及考核条件，并且这些规定的制定经过了合法的民主程序（如职工代表大会讨论、公示等），且内容不违反法律法规的强制性规定，则理论上用人单位可以依据这些规定扣除全勤奖。然而，这种规定必须在合理范围内，且不得违背法律法规的基本原则和精神，特别是不能侵犯劳动者的合法权益。例如，如果规章制度中规定“休年休假期间不享受全勤奖”，但这一规定与法律法规相冲突，或者未经过合法程序制定，那么该规定就是无效的。

3. 劳动者的维权途径

   • 如果劳动者认为用人单位扣除全勤奖的行为不合法，首先应与用人单位进行协商沟通，要求用人单位说明扣奖依据。
   • 协商不成时，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者应提供相关证据，如劳动合同、规章制度、工资条等，以证明自己的主张。

实际建议

1. 了解公司规章制度：劳动者在入职时应仔细阅读并了解公司的规章制度，特别是关于请假、全勤奖等方面的规定。如果规章制度中存在不明确或不合理的地方，应及时向用人单位提出疑问或建议。
2. 保留相关证据：在休年休假期间，劳动者应保留好相关证据，如请假条、工资条等，以备不时之需。如果用人单位扣除全勤奖，劳动者可以凭借这些证据来维护自己的合法权益。
3. 及时咨询与维权：如果劳动者对用人单位扣除全勤奖的行为有疑问或不满，应及时向我咨询或寻求其他法律援助。在维权过程中，劳动者应保持冷静和理性，避免采取过激行为。

总结：劳动者在休带薪年休假期间，其全勤奖一般不应被扣除。如果用人单位扣除全勤奖，劳动者应首先了解公司规章制度和劳动合同中的相关规定，然后与用人单位进行协商沟通。如果协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。