针对您提出的“公司迟到、早退、缺卡怎么处理”的问题，这确实是一个涉及公司管理制度和员工权益的重要话题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，公司一般不具有直接罚款的权力。根据我国《行政处罚法》的规定，罚款是行政处罚的一种，只能由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施。普通用人单位，除非是被具有行政处罚权的行政机关委托的特殊组织，否则不能对其劳动者进行行政处罚，包括罚款。因此，如果公司试图通过罚款来约束员工的迟到、早退行为，这种做法在法律上可能是存在问题的。

那么，公司应该如何处理员工的迟到、早退和缺卡问题呢？

1. 制定明确的考勤制度：

   • 公司应制定一套清晰、明确的考勤制度，包括上下班时间、迟到早退的定义、缺卡的处理方式等。
   • 考勤制度应经过职代会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定，以确保其合法性和公平性。

2. 采用合理的考勤方式：

   • 公司可以采用签到、打卡、指纹识别、面部识别等多种考勤方式，确保考勤数据的准确性和可靠性。
   • 对于缺卡情况，公司可以设定一定的补卡流程或规定，如员工需在规定时间内提交缺卡说明或补卡申请。

3. 实施梯度化的处理措施：

   • 对于迟到、早退行为，公司可以根据情节轻重实施梯度化的处理措施，如口头警告、书面警告、扣减绩效、影响晋升等。
   • 对于频繁迟到、早退或严重缺卡的员工，公司可以依据考勤制度进行更严厉的处理，如通报批评、诫勉谈话、解除劳动合同等。

4. 注重沟通和教育：

   • 在处理迟到、早退问题时，公司应注重与员工的沟通和教育，了解员工迟到早退的原因，帮助员工解决问题，提高员工的纪律意识和工作积极性。

5. 将考勤与考核挂钩：

   • 公司可以将员工的考勤情况与年度考核、晋升、奖金等挂钩，以激励员工遵守考勤制度，提高工作效率。

以某机关单位的考勤制度为例，他们明确规定了迟到、早退的定义和处理方式，如迟到15分钟后到岗为迟到，30分钟后到岗按旷工处理；早退提前15分钟为早退，提前30分钟按旷工处理。同时，他们还设定了梯度化的处理措施，如迟到早退每月累计超过一定次数将进行书面检讨、通报批评、诫勉谈话等。

综上所述，公司在处理员工的迟到、早退和缺卡问题时，应遵循合法、公平、合理的原则，制定明确的考勤制度，采用合理的考勤方式，实施梯度化的处理措施，并注重与员工的沟通和教育。这样既能维护公司的正常秩序和工作效率，又能保障员工的合法权益。