结论：非法转让集体土地所得被没收后，转让合同一般会被认定为无效。不过，具体还需根据转让合同的具体内容、签订背景以及相关法律法规的适用情况来综合判断。

分析说明：

1. 非法转让集体土地的性质：

   • 集体土地属于农村集体所有，其转让受到严格的法律限制。非法转让集体土地，即未经法定程序或未经相关部门批准，擅自将集体土地的使用权或所有权进行转让，这种行为违反了国家关于土地管理的法律法规。

2. 转让合同的有效性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。非法转让集体土地的行为，显然违反了国家关于土地管理的强制性规定，因此，基于这种非法行为所签订的转让合同，一般会被认定为无效。
   • 无效的合同自始没有法律约束力，即合同从签订之时起就不具有法律效力，双方当事人不能依据该合同主张权利或履行义务。

3. 非法所得被没收的影响：

   • 非法转让集体土地所得被没收，是国家对非法行为的制裁措施之一。这一措施的实施，进一步证明了转让行为的非法性，也强化了转让合同无效的法律后果。
   • 被没收非法所得并不改变转让合同本身的无效性质，只是对非法行为的一种经济处罚。

4. 特殊情况下的合同效力：

   • 虽然非法转让集体土地的合同一般无效，但在某些特殊情况下，如转让行为已经得到相关部门的追认或补办手续，或者合同双方已经履行了主要义务且对方接受等，合同可能会被认定为有效。不过，这种情况较为罕见，且需要严格的法律条件和程序支持。

行动建议：

• 对于转让方：如果已经签订了非法转让集体土地的合同，且合同被认定为无效，那么转让方可能需要承担返还财产、赔偿损失等法律责任。因此，建议转让方在签订合同前务必了解相关法律法规，确保转让行为的合法性。
• 对于受让方：如果已经支付了转让费用但合同被认定为无效，受让方有权要求转让方返还费用并赔偿损失。同时，受让方也应谨慎选择交易对象，避免陷入非法转让的纠纷中。
• 双方均可：在面临此类纠纷时，建议双方及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，以便更好地维护自己的合法权益。

法律后果：

• 如果转让合同被认定为无效，双方可能需要承担返还财产、赔偿损失等法律责任。具体责任承担方式需根据合同内容、双方过错程度以及实际损失情况等因素综合判断。
• 非法转让集体土地的行为还可能面临行政处罚或刑事处罚的风险，如罚款、没收违法所得、责令限期改正、甚至可能构成非法转让土地使用权罪等。